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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004454`

染色体: Chr07 坐标: 57145985-57148946 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004454`
名称	SmilChr07G004454
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57145985 - 57148946 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995066`
GeneID	`130995066`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995066`
原始查询	`LOC130995066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG8
产物	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG8
Arabidopsis	`AT5G11950` (LOG8) Putative lysine decarboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831068] identity=78.8; qcov=0.969; evalue=9.26e-90; confidence=high
Rice	`Os01g0708500` (LOGL1) - identity=71.4; qcov=1; evalue=1.07e-80; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0016799 (hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds)
KEGG	-
Pfam	PF03641 (Lysine_decarbox); PF18306 (LDcluster4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995066

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776197.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057776197.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057776198.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776197.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57146993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B47,C87
`Chr7:57147435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:57148279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776197.1

216 aa

108

216

LDcluster4

Lysine_decarbox

PF18306 LDcluster4 25-126 aa PF03641 Lysine_decarbox 56-186 aa

XP_057776198.1

161 aa

161

Lysine_decarbox

PF03641 Lysine_decarbox 1-131 aa

XP_057776199.1

161 aa

161

Lysine_decarbox

PF03641 Lysine_decarbox 1-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776197.1`	Pfam	`PF18306`	LDcluster4	Family	25	126	3e-11	43.9	SLOG cluster4 family
`XP_057776197.1`	Pfam	`PF03641`	Lysine_decarbox	Family	56	186	1.4e-46	158.6	Possible lysine decarboxylase
`XP_057776198.1`	Pfam	`PF03641`	Lysine_decarbox	Family	1	131	6e-47	159.8	Possible lysine decarboxylase
`XP_057776199.1`	Pfam	`PF03641`	Lysine_decarbox	Family	1	131	6e-47	159.8	Possible lysine decarboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920214.1
ATGTAACATGCATAGCCATCTTGTACGACTATGAGTTTACATGTTGAATCCATCAAATCCAATAAATACATAAATATAATGAGAGTTGGTAATTTATTTTAACAATTATTTGTTTATATATTTTATAAGATATTAAAAGAATTAGGTTTCAACTAGTATCATGTATCGATCTTGCTCGAAGATCAGATTTGTGATGTATTCAAATCTTATTAAATTAAATTTTATATACAATTAATATTTGTGTACATTTCTCACACGCA...

XM_057920216.1
GTTTATGCAAAAACACACACACACACTCACAGGTGAAAAGGAAAATAAACTTGGTTTATGGAGGTGGGAGTGTAGGGCTAATGGGATTATTGTCACAGAGAGTTTATGATGGTGGTTGCCATGTTCTTGGAGTTATCCCAAAAGCTCTTGTTCCCATTGAGATATCAGGAGAGACTGTTGGTGATGTGAGGATAGTTTCTGACATGCACGAACGGAAGGCTGATATGGCTCGTGAGGCTGAAGCATTTATCGCCCTTCCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130995066
ATGGAAAACAATTCAAGAAGCGCCAACAAATTCAAGAAAATCTGTGTGTTCTGTGGGAGTAATCCAGGCCACAGGAAAGTCTTCAGTGATGCTGCTATTGACTTGGGAAATGAACTGGTGAAAAGGAAAATAAACTTGGTTTATGGAGGTGGGAGTGTAGGGCTAATGGGATTATTGTCACAGAGAGTTTATGATGGTGGTTGCCATGTTCTTGGAGTTATCCCAAAAGCTCTTGTTCCCATTGAGATATCAGGAGAGAC...

LOC130995066
ATGGGATTATTGTCACAGAGAGTTTATGATGGTGGTTGCCATGTTCTTGGAGTTATCCCAAAAGCTCTTGTTCCCATTGAGATATCAGGAGAGACTGTTGGTGATGTGAGGATAGTTTCTGACATGCACGAACGGAAGGCTGATATGGCTCGTGAGGCTGAAGCATTTATCGCCCTTCCTGGAGGATATGGAACGATGGAGGAATTGCTCGAGATGATAACTTGGGCGCAGCTTGGGATCCATAAAAAGCCGGTTGGCTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057776197.1
MENNSRSANKFKKICVFCGSNPGHRKVFSDAAIDLGNELVKRKINLVYGGGSVGLMGLLSQRVYDGGCHVLGVIPKALVPIEISGETVGDVRIVSDMHERKADMAREAEAFIALPGGYGTMEELLEMITWAQLGIHKKPVGLLNVDGYYDPLLTLFDKGVEEGFIKPAARHIVLSAPTAEELLTKMEQRAPFDDHVAPHESWQMEQLGNYPTERET

XP_057776198.1
MGLLSQRVYDGGCHVLGVIPKALVPIEISGETVGDVRIVSDMHERKADMAREAEAFIALPGGYGTMEELLEMITWAQLGIHKKPVGLLNVDGYYDPLLTLFDKGVEEGFIKPAARHIVLSAPTAEELLTKMEQRAPFDDHVAPHESWQMEQLGNYPTERET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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