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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003674`

染色体: Chr01 坐标: 55172598-55174848 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003674`
名称	SmilChr01G003674
描述	HMG1/2-like protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55172598 - 55174848 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995075`
GeneID	`130995075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995075`
原始查询	`LOC130995075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HMG1/2-like protein
产物	HMG1/2-like protein
Arabidopsis	`AT1G20693` (HMGB2) high mobility group B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838658] identity=61.3; qcov=1.04; evalue=6.29e-51; confidence=high
Rice	`Os09g0551600` - identity=62.6; qcov=0.956; evalue=5.98e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00505 (HMG_box); PF09011 (HMG_box_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776210.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057776210.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057776210.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776210.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55173207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:55173227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:55173360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B10,B126,B27,B28,B29,B33,B58,B8,C10,C41,C44,C64,C77,D4,D8
`Chr1:55173649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr1:55173652`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A13,B109,C4
`Chr1:55173652`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A13,B109,C4
`Chr1:55173656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B28,C37,D4,D5
`Chr1:55173685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776210.1

137 aa

137

HMG_box_2

HMG_box

PF09011 HMG_box_2 32-104 aa PF00505 HMG_box 35-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776210.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	32	104	2.5e-15	57.6	HMG-box domain
`XP_057776210.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	35	104	1.6e-23	83.6	HMG (high mobility group) box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920227.1
AAAGCGATTTGGAGGGACTTCAATAGTACCGACTTCACCCCTCCCCTTATAATATCTTCACAATTCTTCTTTTCTCCTCAAATCCGACACCCTTGTTTCCCTCTCTGCTTTCTCTTTCTCTCCTCAAAAAAAAGCCAAAGCAAAACCCTAACCCTAGCTCTCTGCTTTCTCTGTGCTCGTCATGAAAGGAGGAAAAACGAGAGCTGATTCGAAGAGGTCTGAAAGCAGGCTTGGTGTGAAGATGTCAAAGAAGGAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995075
ATGAAAGGAGGAAAAACGAGAGCTGATTCGAAGAGGTCTGAAAGCAGGCTTGGTGTGAAGATGTCAAAGAAGGAGAAGAAAGCTGCAAAGGACCCGAACAAGCCAAAAAGGCCTCCAAGTGCTTTCTTTGTTTTCATGGAAGACTTTAGGAAGCAATATAAAGAAAAGCATCCTAACAACAAATCAGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGTGATAGGTGGAAGTCATTGAGTGAGGAGGAAAAGGCCCCATATGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776210.1
MKGGKTRADSKRSESRLGVKMSKKEKKAAKDPNKPKRPPSAFFVFMEDFRKQYKEKHPNNKSVAAVGKAGGDRWKSLSEEEKAPYVAEAEKRKEGYERNMEAYNRKLAGGADDDSDKSKSEVNDEDEEGSGEEEDDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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