当前解析结果
SmilChr07G004470| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004470 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004470 |
| 描述 | leucine-rich repeat extensin-like protein 6 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 57262644 - 57263482 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995076 |
|---|---|
| GeneID | 130995076 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995076 |
| 原始查询 | LOC130995076 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | leucine-rich repeat extensin-like protein 6 |
| 产物 | leucine-rich repeat extensin-like protein 6 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995076 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057776206.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057776206.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776206.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776206.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776206.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:57262837 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B25,C3,C83 |
Chr7:57262840 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr7:57262902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B25,C3 |
Chr7:57262903 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B110 |
Chr7:57262945 |
GTA |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | A8,B14,B3,B69,C59 |
Chr7:57263081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,C46,D7 |
Chr7:57263103 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:57263130 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:57263299 |
A |
AAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B85 |
Chr7:57263299 |
A |
AAG |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。