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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004476`

染色体: Chr07 坐标: 57308048-57310296 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004476`
名称	SmilChr07G004476
描述	thioredoxin-like protein YLS8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57308048 - 57310296 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995081`
GeneID	`130995081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995081`
原始查询	`LOC130995081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin-like protein YLS8
产物	thioredoxin-like protein YLS8
Arabidopsis	`AT5G08290` (YLS8) mRNA splicing factor, thioredoxin-like U5 snRNP [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830725] identity=95.8; qcov=1; evalue=5.21e-104; confidence=high
Rice	`Os10g0486600` (DIM1) - identity=96.5; qcov=1; evalue=1.98e-104; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0005682 (U5 snRNP); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF02966 (DIM1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776215.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776215.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057776215.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776215.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57308510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,C85
`Chr7:57308540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,C85
`Chr7:57308549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C85
`Chr7:57308552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C85
`Chr7:57308555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C85
`Chr7:57308558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B102,B64,C26,C37
`Chr7:57308622`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C10
`Chr7:57308622`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C10
`Chr7:57310047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B138
`Chr7:57310074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776215.1

142 aa

142

DIM1

Thioredoxin

PF02966 DIM1 4-136 aa PF00085 Thioredoxin 17-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776215.1`	Pfam	`PF02966`	DIM1	Domain	4	136	3.4e-68	228.2	Mitosis protein DIM1
`XP_057776215.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	17	102	1.4e-06	29.0	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920232.1
ATTAGATTCGTTATTATACCAATTGGTTAAATTTTTTATTAGAAAATTCGAAATCGAATTTCTATATTTTTGCCTTTTAGATTTTTTTTATATACACAAACAATTTCTCCAATTGCAAAGCTTCAGCTCAGCCTACAGTCTTACCGACTCCGAGAGAAAATCGATAGCCTGTACGATGTCGTATTTGCTGCCTCACCTTCACTCCGGCTGGGCCGTCGATCAGGCGATCCTGGCGGAGGAGGAGCGCCTCGTCCTCATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995081
ATGTCGTATTTGCTGCCTCACCTTCACTCCGGCTGGGCCGTCGATCAGGCGATCCTGGCGGAGGAGGAGCGCCTCGTCCTCATCCGCTTCGGCCACGATTGGGACGAGACCTGCATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCCTCAGTTGCCGAAACACTAAAGAACTTTGCTGTCATATACCTGGTGGATATCACAGAGGTCCCGGACTTCAACACAATGTACGAGCTGTACGACCCCTCCACCATCATGTTCTTTTTCAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776215.1
MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERLVLIRFGHDWDETCMQMDEVLASVAETLKNFAVIYLVDITEVPDFNTMYELYDPSTIMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMKDKQEFIDIVETVYRGARKGRGLVIAPKDYSTKYRY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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