当前解析结果
SmilChr01G003679| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003679 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003679 |
| 描述 | MLO protein homolog 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 55200909 - 55204784 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995124 |
|---|---|
| GeneID | 130995124 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995124 |
| 原始查询 | LOC130995124 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MLO protein homolog 1-like |
| 产物 | MLO protein homolog 1-like |
| Arabidopsis | AT1G61560 (MLO6)Seven transmembrane MLO family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842450] identity=46.7; qcov=0.99; evalue=4.7e-163; confidence=high |
| Rice | Os03g0129100 (OsMLO2)- identity=59.8; qcov=0.926; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0006952 (defense response); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03094 (Mlo) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995124 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057776261.1 |
| 2 | Dendrite | Dendrite | 0.20000 | XP_057776273.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057776261.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776261.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776261.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:55201858 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B22,B41,C72 |
Chr1:55203874 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B90,B92,D6 |
Chr1:55204008 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B106,B22,B41,B73,C72 |
Chr1:55204029 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776261.1PF03094
Mlo 7-493 aa
XP_057776267.1PF03094
Mlo 7-481 aa
XP_057776273.1PF03094
Mlo 1-443 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776261.1 |
Pfam | PF03094 |
Mlo | Family | 7 | 493 | 8.7e-222 | 737.4 | Mlo family |
XP_057776267.1 |
Pfam | PF03094 |
Mlo | Family | 7 | 481 | 1e-208 | 694.4 | Mlo family |
XP_057776273.1 |
Pfam | PF03094 |
Mlo | Family | 1 | 443 | 2.9e-199 | 663.2 | Mlo family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。