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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003680`

染色体: Chr01 坐标: 55211791-55214783 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003680`
名称	SmilChr01G003680
描述	uncharacterized SmilChr01G003680
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55211791 - 55214783 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995152`
GeneID	`130995152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995152`
原始查询	`LOC130995152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inner membrane localized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840894]; symbol=AT1G42960; hit=AT1G42960; species=arabidopsis; confidence=high
产物	inner membrane localized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840894]; symbol=AT1G42960; hit=AT1G42960; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G42960` (AT1G42960) inner membrane localized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840894] identity=64.2; qcov=0.812; evalue=4.73e-57; confidence=high
Rice	`Os12g0583400` - identity=43.8; qcov=0.485; evalue=1.24e-10; confidence=low
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009706 (chloroplast inner membrane)
KEGG	-
Pfam	PF27515 (Ssl2009_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776289.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057776289.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057776289.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057776289.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55214421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:55214467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B22,B41,B73,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776289.1

165 aa

165

Ssl2009_C

PF27515 Ssl2009_C 115-148 aa

XP_057776296.1

165 aa

165

Ssl2009_C

PF27515 Ssl2009_C 115-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776289.1`	Pfam	`PF27515`	Ssl2009_C	Domain	115	148	2.3e-11	44.2	Ssl2009 C-terminal domain
`XP_057776296.1`	Pfam	`PF27515`	Ssl2009_C	Domain	115	148	2.3e-11	44.2	Ssl2009 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920306.1
AACAAAACTAAAAATTGAACATAGCAAAACGTTTTTACATCTTCGATTTCATCGACACCAACAGAAAAGAAAATAAATGAAAAGTAGCAAACACAAGAATGGCGGCTCTGTCCAATTCCGTTGTGATTTCGAGGAGCTCCGCAATCGATTTATCTTCCGGTTCTTCTTTGAAGTCTGCTGATCAATTTGTGAGACCCACTAACTTGGCCTTGAGTTTTAAGGGCAACAGGAGACCATCCACCCACAGAAAGATACTCACT...

XM_057920313.1
GTTTTTACATCTTCGATTTCATCGACACCAACAGAAAAGAAAATAAATGAAAAGTAGCAAACACAAGGTGAAAGAGAATGGCGGCTCTGTCCAATTCCGTTGTGATTTCGAGGAGCTCCGCAATCGATTTATCTTCCGGTTCTTCTTTGAAGTCTGCTGATCAATTTGTGAGACCCACTAACTTGGCCTTGAGTTTTAAGGGCAACAGGAGACCATCCACCCACAGAAAGATACTCACTGTTCAAGCCAGTTATAGTGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995152
ATGGCGGCTCTGTCCAATTCCGTTGTGATTTCGAGGAGCTCCGCAATCGATTTATCTTCCGGTTCTTCTTTGAAGTCTGCTGATCAATTTGTGAGACCCACTAACTTGGCCTTGAGTTTTAAGGGCAACAGGAGACCATCCACCCACAGAAAGATACTCACTGTTCAAGCCAGTTATAGTGATGGTGGAAGGCCTGGCAGTGCAAGTATCTTTGTCAGTGGCTTTGTTTTAGGGGGATTAATTGTTGGCACACTCGGTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776289.1
MAALSNSVVISRSSAIDLSSGSSLKSADQFVRPTNLALSFKGNRRPSTHRKILTVQASYSDGGRPGSASIFVSGFVLGGLIVGTLGCVYAPQISKALTGTDKKDLMKKLPKFIYDEEKALEKQRKKLAEKIAQLNDAIDNVSTQLRSEEPPNGAAVSSDDIEALI

XP_057776296.1
MAALSNSVVISRSSAIDLSSGSSLKSADQFVRPTNLALSFKGNRRPSTHRKILTVQASYSDGGRPGSASIFVSGFVLGGLIVGTLGCVYAPQISKALTGTDKKDLMKKLPKFIYDEEKALEKQRKKLAEKIAQLNDAIDNVSTQLRSEEPPNGAAVSSDDIEALI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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