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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004617`

染色体: Chr07 坐标: 58963866-58968306 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004617`
名称	SmilChr07G004617
描述	ankyrin repeat-containing protein ITN1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58963866 - 58968306 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995196`
GeneID	`130995196`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995196`
原始查询	`LOC130995196`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein ITN1-like
产物	ankyrin repeat-containing protein ITN1-like
Arabidopsis	`AT5G51160` (AT5G51160) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835190] identity=27.1; qcov=0.839; evalue=3.1e-26; confidence=low
Rice	`Os11g0182900` - identity=27.2; qcov=0.934; evalue=5.15e-29; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995196

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776334.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776334.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776334.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776334.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58964452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A21,B38,B44,B53,B68,C3,C67,C69
`Chr7:58964519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:58964621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C40
`Chr7:58964626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C40
`Chr7:58964640`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A21,B125,B38,B44,B46,B53,B6,B68,B93,C11,C17,C3,C58,C60,C69,C71,D1
`Chr7:58964646`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B26
`Chr7:58964646`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B26
`Chr7:58964698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C80
`Chr7:58964706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C80
`Chr7:58964743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C80
`Chr7:58964748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C80
`Chr7:58964749`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B65,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776334.1

409 aa

204

409

Ank_2

Ank

Ank_4

Ank_2

Ank_4

Ank

PGG

PF12796 Ank_2 27-92 aa PF00023 Ank 73-91 aa PF00023 Ank 106-126 aa PF13637 Ank_4 109-159 aa PF12796 Ank_2 109-195 aa PF13637 Ank_4 143-193 aa PF00023 Ank 172-194 aa PF13962 PGG 244-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	27	92	1.9e-27	96.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	73	91	1.4e-23	82.4	Ankyrin repeat
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	106	126	1.4e-23	82.4	Ankyrin repeat
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	109	159	2e-19	69.9	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	109	195	1.9e-27	96.4	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	143	193	2e-19	69.9	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	172	194	1.4e-23	82.4	Ankyrin repeat
`XP_057776334.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	244	356	2.1e-24	86.3	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920351.1
CTCAAATTGTCAATCTAATTGGACCAACCCACAAATATCGGGCTGAATTGACATCCGTAATCACAATTGACTTGAGGCCATTTTTTTTATATAAGCTCAACTCTTCGTTCACAATATCGTTTCCACTTTTGTTATTTTAGTTTGTCTATGATATCTTTTCCACTTTCATTTATAACAATAGGACCCACAAACTCCACTCACAATAATAGTGGGACCCAACCTCCACTCGCAATAATACTCACTACTATCCATCATTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995196
ATGAGTGGTGAAAAACTTTATGATGCTATATTGAAAGGGGATGTAACAAGATTTCGAGAAGTGGTTCAACAAGATCCATATCTTATTGAAAGTGCTTCATTTGCATGTTCAAGAAATGCTCTACACATAGCAACACTGCGGGGGCAAGTAGCCATGGTTGAAGAGGTGTTGAACATCAACCCGCAGCTAGCTCGAGATTTGGACTCCCAACAATCATCACCTCTTCACATCGCAGCTGCGGAAGGGAGCCTTGAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776334.1
MSGEKLYDAILKGDVTRFREVVQQDPYLIESASFACSRNALHIATLRGQVAMVEEVLNINPQLARDLDSQQSSPLHIAAAEGSLEMVKKLLSVTPEACWWRDCHDMNPIHIAAMNGHEEVLKELLQLNLLAAMERLHRGQTVLHLCVKHRQLNTLKVLVDKFDEFLGAKDDDGETILHLAARSNHQEITEYLVESDKIREFITMDRLSKRSLSMSSKLRSGDRRSLENIKLLQILSTGKTMIEKVAKWNDVAMVVAVLIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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