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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004621`

染色体: Chr07 坐标: 59019326-59026140 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004621`
名称	SmilChr07G004621
描述	omega-amidase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59019326 - 59026140 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995207`
GeneID	`130995207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995207`
原始查询	`LOC130995207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	omega-amidase, chloroplastic-like
产物	omega-amidase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G12040` (AT5G12040) Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831077] identity=77.5; qcov=0.927; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0175600` (OsCPA2) - identity=76.1; qcov=0.829; evalue=2.19e-167; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006107 (oxaloacetate metabolic process); GO:0006528 (GO:0006528); GO:0006541 (L-glutamine metabolic process); GO:0050152 (omega-amidase activity)
KEGG	smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00795 (CN_hydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776346.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057776346.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776346.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776346.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59019455`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B11,B17,C21,C7,D1
`Chr7:59019455`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B11,B17,C21,C7,D1
`Chr7:59019462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:59019504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B113,B27,B53,C49
`Chr7:59019543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C87
`Chr7:59019574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:59019606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:59019627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:59019628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:59020530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:59020532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:59020563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776346.1

369 aa

184

369

CN_hydrolase

PF00795 CN_hydrolase 89-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776346.1`	Pfam	`PF00795`	CN_hydrolase	Family	89	342	8.6e-64	216.0	Carbon-nitrogen hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920363.1
AGAAATAATTAATATATTTATCTCAATGAAAAAAAAAAAAAAAAGTGACAAAAATTAGTAGTAATGTGAGTAGTGAGGTCGAAAGGGAAAGAGAGAGAAATGAGGGGATTAGTAGTGGCGTTATCTTCAACTCTCACTCTTCAATCCTCTGCAGCTCGCTCCACCGTGGGCCCTGCCACCTCCCACATCCTCCACCGTCTATTCCAGCGTACTCCCACTCAAAGCACAAGTCTCCACACTAAGTCAACCCGTACAACACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995207
ATGAGGGGATTAGTAGTGGCGTTATCTTCAACTCTCACTCTTCAATCCTCTGCAGCTCGCTCCACCGTGGGCCCTGCCACCTCCCACATCCTCCACCGTCTATTCCAGCGTACTCCCACTCAAAGCACAAGTCTCCACACTAAGTCAACCCGTACAACACTTGCAGCGTCCGCCTCACTCTCATCCATGGCCGCCTCTTTCTCCCCGGAGAAGGCCCGAGTGCCCCCAGCCCTGCCGGCGCCCGCTCCTCCCATCACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776346.1
MRGLVVALSSTLTLQSSAARSTVGPATSHILHRLFQRTPTQSTSLHTKSTRTTLAASASLSSMAASFSPEKARVPPALPAPAPPITKFKIGICQLKVTADKERNILHARTAVEEAAEKGAKLVLLPEIWNSPYSNDSFPVYAEDIDAGFDASPSTAMLAETARRLNITLIGGSIPERSGDKLYNTCCVYGPDGKLKAKHRKIHLFDIDIPGKITFKESQTLTAGETPTVVDTEVGRIGIGICYDIRFQELAMLYCARGAQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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