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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004625`

染色体: Chr07 坐标: 59051782-59055102 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004625`
名称	SmilChr07G004625
描述	thermospermine synthase ACAULIS5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59051782 - 59055102 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995209`
GeneID	`130995209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995209`
原始查询	`LOC130995209`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thermospermine synthase ACAULIS5-like
产物	thermospermine synthase ACAULIS5-like
Arabidopsis	`AT5G19530` (ACL5) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832073] identity=73.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0237100` (OsACL5) - identity=69.3; qcov=0.962; evalue=3.14e-170; confidence=high
GO	GO:0006596 (polyamine biosynthetic process); GO:0010487 (thermospermine synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01564 (Spermine_synth); PF17284 (Spermine_synt_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776349.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776349.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057776349.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057776349.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59051917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:59052183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:59052229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:59052344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:59052380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:59053054`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B113
`Chr7:59053054`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B113
`Chr7:59053119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr7:59053260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,C31,C50,C75
`Chr7:59053512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:59054872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C26,C56,C87,D5
`Chr7:59054936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776349.1

342 aa

171

342

Spermine_synt_N

Spermine_synth

PF17284 Spermine_synt_N 39-90 aa PF01564 Spermine_synth 93-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776349.1`	Pfam	`PF17284`	Spermine_synt_N	Domain	39	90	1.3e-13	51.3	Spermidine synthase tetramerisation domain
`XP_057776349.1`	Pfam	`PF01564`	Spermine_synth	Domain	93	275	1.7e-45	155.6	Spermine/spermidine synthase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920366.1
CATTCAACTCAGCATTGTTAATTTAAGGTTGTTTTCTCCCTCTCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTAAACATTTTATATAATTAGTAACAATTTAAAAAAGAATGAGTGAAGCTGTGGAATTCTTTCCTTACAACAATGGCTTCTCATCAAAGGTGCACTACGAAAACAGTCACTTGATCTTAGATCAAAATCAGGAGGAAGAAAAGCAAGATTCTTGGTTTGAAGAAGTGATCGATGATGATCTAAAATGGTCTTTTGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995209
ATGAGTGAAGCTGTGGAATTCTTTCCTTACAACAATGGCTTCTCATCAAAGGTGCACTACGAAAACAGTCACTTGATCTTAGATCAAAATCAGGAGGAAGAAAAGCAAGATTCTTGGTTTGAAGAAGTGATCGATGATGATCTAAAATGGTCTTTTGCTTTGAACAGAGTGCTGCACAAAGGAACTAGTGTGTATCAAGACATTGCTCTTCTCGACACCAAACGATTTGGGAAGGTTTTGGTGATTGATGGGAAGATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776349.1
MSEAVEFFPYNNGFSSKVHYENSHLILDQNQEEEKQDSWFEEVIDDDLKWSFALNRVLHKGTSVYQDIALLDTKRFGKVLVIDGKMQSAEIDEYIYHECLIHPALLCHPNPKTVFIMGGGEGSTAREALRHKSVENVIMCDIDQEVVDFCRKHLTANHDAFRNKKLNLVINDAKAELEKREEKFDIIVGDLADPVEGGPCYQLYTKSFYENILKPKLNNNGIFVTQAGPGGLFTHKEVFSSIYNTIRQVFKYVRAYTAHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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