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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004640`

染色体: Chr07 坐标: 59267869-59269164 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004640`
名称	SmilChr07G004640
描述	uncharacterized SmilChr07G004640
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59267869 - 59269164 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995211`
GeneID	`130995211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995211`
原始查询	`LOC130995211`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776351.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057776351.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776351.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776351.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59268216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B90,B92,C6
`Chr7:59268218`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A6,B25,B30,B85,C1,C37,C82,C85,D4
`Chr7:59268255`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A13,A21,A24,B34,B49,B82,C14,C25,C73,C83
`Chr7:59268307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C52,C53
`Chr7:59268375`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B121,B125,C21,C83
`Chr7:59268375`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B121,B125,C21,C83
`Chr7:59268391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B132,B94,D7
`Chr7:59268399`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A15,A25,A4,B110,B123,B126,B19,B20,B24,B37,B4,B5,B50,B51,B52,B54,B59,B65,B69,B75,B77,B81,B9,C22,C4,C48,C7,C74
`Chr7:59268423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B26,B63,B94,C85
`Chr7:59268443`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr7:59268443`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr7:59268450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A8,B132,B6,C11,C69,C71,D1,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776351.1

329 aa

164

329

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 13-233 aa PF07734 FBA_1 23-266 aa

XP_057776352.1

322 aa

161

322

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 13-233 aa PF07734 FBA_1 23-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776351.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	13	233	5.2e-19	69.1	F-box associated beta propeller domain
`XP_057776351.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	23	266	1e-13	51.7	F-box associated beta propeller domain
`XP_057776352.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	13	233	4.9e-19	69.2	F-box associated beta propeller domain
`XP_057776352.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	23	266	9.5e-14	51.8	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920369.1
AGGAGTCAGATCCTGGGCTGTACGCATCAGAGATAAAATCAGTGTCTCAACCTATGACTGACATTTGTTTCCTTTCTTATGATAAAGACGAGTATCCATATTTTAGTGCATATTCAGTTGATGAAGAGGATGGCAGCATTTCACCAAAATACTACATTTATCCTCCCTCTCCTATAAAGCAACATGGGATCTTCCGTGGCGCTACTTGTAATGGTGTATTCCACTTTATGAATGATCACGACCAGCATATGATGTGGAAC...

XM_057920368.1
AGGAGTCAGATCCTGGGCTGTACGCATCAGAGATAAAATCAGTGTCTCAACCTATGACTGACATTTGTTTCCTTTCTTATGATAAAGACGAGTATCCATATTTTAGTGCATATTCAGTTGATGAAGAGGATGGCAGCATTTCACCAAAATACTACATTTATCCTCCCTCTCCTATAAAGCAACATGGGATCTTCCGTGGCGCTACTTGTAATGGTGTATTCCACTTTATGAATGATCACGACCAGCATATGATGTGGAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995211
ATGACTGACATTTGTTTCCTTTCTTATGATAAAGACGAGTATCCATATTTTAGTGCATATTCAGTTGATGAAGAGGATGGCAGCATTTCACCAAAATACTACATTTATCCTCCCTCTCCTATAAAGCAACATGGGATCTTCCGTGGCGCTACTTGTAATGGTGTATTCCACTTTATGAATGATCACGACCAGCATATGATGTGGAACCTAACAACAAATGAGTGTAAGGCCCTCCCCATGTCCTTTGATCGACGCCCTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776351.1
MTDICFLSYDKDEYPYFSAYSVDEEDGSISPKYYIYPPSPIKQHGIFRGATCNGVFHFMNDHDQHMMWNLTTNECKALPMSFDRRPRLDSPVVASGMWYDHTRENYKLLQFVRNYAIFEEDEADDSIWLYSLKSNSWKTLPRMFSPASTCTNDVFYCGASFGESECIISFNFSTETLSKIHLPLLDKTKCYQIMEYKGLLSIVVYSSMFGTNREPSEYELWVMNDGLWSRESVFHVCGVHEPVWFSRNGRFLYFESFRDE...

XP_057776352.1
MTDICFLSYDKDEYPYFSAYSVDEEDGSISPKYYIYPPSPIKQHGIFRGATCNGVFHFMNDHDQHMMWNLTTNECKALPMSFDRRPRLDSPVVASGMWYDHTRENYKLLQFVRNYAIFEEDEADDSIWLYSLKSNSWKTLPRMFSPASTCTNDVFYCGASFGESECIISFNFSTETLSKIHLPLLDKTKCYQIMEYKGLLSIVVYSSMFGTNREPSEYELWVMNDGLWSRESVFHVCGVHEPVWFSRNGRFLYFESFRDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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