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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000966`

染色体: Chr01 坐标: 20503283-20504971 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000966`
名称	SmilChr01G000966
描述	uncharacterized SmilChr01G000966
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20503283 - 20504971 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995216`
GeneID	`130995216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995216`
原始查询	`LOC130995216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995216

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776433.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057776433.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057776433.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776433.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776433.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20503286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:20503287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B125,B90,B92
`Chr1:20503319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:20503321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C62,C87,D2
`Chr1:20503334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:20503391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr1:20503399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:20503451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B71,C13,C26
`Chr1:20503516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C57
`Chr1:20503528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C26,C82
`Chr1:20503561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:20503576`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A13,A21,A3,A6,A8,B101,B102,B127,B131,B136,B20,B30,B41,B44,B50,B51,B53,B60,B7,B72,B83,B84,B89,B95,B97,B99,C19,C22,C24,C28,C45,C47,C51,C59,C6,C70,C73,C77,D3,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776433.1

149 aa

149

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 2-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776433.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	2	104	5.7e-15	56.2	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920450.1
ATGGCGAAAGCTTATATTATGATCACTATGTCTTCTGCGTTGCAGCTGGAACATCAGTCGTTGGAGACTACGGCTACAATTATGAGGAACCTCGAGGAGCTCTTTGGGGAATCGGACCGATCAGTCCGTTTTGTACTCATGAGGAAACTCATGTCTTCAAATATGACAGAAGGTTCGTCTGTGCGCGAGCACGTGCTTGGAATGATTAATCATTTCAATGAGCTGGACGTGCTCGGTGGAAGAATCGAGGATGCTACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995216
ATGGCGAAAGCTTATATTATGATCACTATGTCTTCTGCGTTGCAGCTGGAACATCAGTCGTTGGAGACTACGGCTACAATTATGAGGAACCTCGAGGAGCTCTTTGGGGAATCGGACCGATCAGTCCGTTTTGTACTCATGAGGAAACTCATGTCTTCAAATATGACAGAAGGTTCGTCTGTGCGCGAGCACGTGCTTGGAATGATTAATCATTTCAATGAGCTGGACGTGCTCGGTGGAAGAATCGAGGATGCTACTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776433.1
MAKAYIMITMSSALQLEHQSLETTATIMRNLEELFGESDRSVRFVLMRKLMSSNMTEGSSVREHVLGMINHFNELDVLGGRIEDATKVDMVLHTLPKSYENFRLNAVYLMGMVDPSFGGLNHLAVIAIEWFSLSSWSFGSMPLNLFARP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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