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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004682`

染色体: Chr07 坐标: 59785567-59786854 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004682`
名称	SmilChr07G004682
描述	agglutinin-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59785567 - 59786854 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995248`
GeneID	`130995248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995248`
原始查询	`LOC130995248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agglutinin-like
产物	agglutinin-like
Arabidopsis	`AT1G19715` (AT1G19715) Mannose-binding lectin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838560] identity=32.1; qcov=0.891; evalue=1.28e-31; confidence=low
Rice	`Os05g0508400` - identity=35; qcov=0.851; evalue=5.86e-33; confidence=medium
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF01419 (Jacalin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776445.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057776445.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776445.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776445.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776445.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59785644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B70,C23,C66
`Chr7:59785675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C29,C8
`Chr7:59785757`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A16,B3,B68,C83
`Chr7:59785757`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A16,B3,B68,C83
`Chr7:59785767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:59785823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,B99,C49
`Chr7:59785934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,C35,C63,C67
`Chr7:59786011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C21,C39
`Chr7:59786103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B25,C35,C53
`Chr7:59786143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C36
`Chr7:59786164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr7:59786253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776445.1

349 aa

174

349

Jacalin

PF01419 Jacalin 29-165 aa PF01419 Jacalin 197-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776445.1`	Pfam	`PF01419`	Jacalin	Repeat	29	165	2.7e-55	187.2	Jacalin-like lectin domain
`XP_057776445.1`	Pfam	`PF01419`	Jacalin	Repeat	197	345	2.7e-55	187.2	Jacalin-like lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920462.1
TGAGACATGCATGCATATTCGAAGGTAACACCAACTAAACTTGGAGAATTTGTGCAGGAAAAAGAGTGCAGTTGTGTGGGAGAGATCGCTTTGGGGCCATGGGGATGCCACTCCGACACGGCCCGTCAATGGAGCTATAAACCAAAAGCAGGAGGCGCCATCAAAAAAATTATCATAGGCTGCGGTTGGATAATCGATTCCCTCATGTTTAAGGCCGACGATTACTCCGCCAAATTCGGCGGCCACGGTGGTGACGCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995248
ATGCATGCATATTCGAAGGTAACACCAACTAAACTTGGAGAATTTGTGCAGGAAAAAGAGTGCAGTTGTGTGGGAGAGATCGCTTTGGGGCCATGGGGATGCCACTCCGACACGGCCCGTCAATGGAGCTATAAACCAAAAGCAGGAGGCGCCATCAAAAAAATTATCATAGGCTGCGGTTGGATAATCGATTCCCTCATGTTTAAGGCCGACGATTACTCCGCCAAATTCGGCGGCCACGGTGGTGACGCATTCCCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776445.1
MHAYSKVTPTKLGEFVQEKECSCVGEIALGPWGCHSDTARQWSYKPKAGGAIKKIIIGCGWIIDSLMFKADDYSAKFGGHGGDAFPRIRIDHPSEFLIGISGTFGKVEHMEPDNVCTLTFHTNKNQYGPFGTKPGPTPFSLIANGAAVTGFHGRCGQYVEAIGLYVKPLSIQLKKQPSENASSRVPRFLLPPRSAAAMGGSGGRDWDDGVFAAVKGVHACVRVDTGALSAVRFSYLKSDGSAFLSPFHGGYCEGDVHLKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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