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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003694`

染色体: Chr01 坐标: 55300022-55302881 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003694`
名称	SmilChr01G003694
描述	SWI/SNF complex subunit SWI3B
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55300022 - 55302881 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995250`
GeneID	`130995250`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995250`
原始查询	`LOC130995250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SWI/SNF complex subunit SWI3B
产物	SWI/SNF complex subunit SWI3B
Arabidopsis	`AT2G33610` (SWI3B) switch subunit 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817927] identity=56.1; qcov=0.932; evalue=1.6e-154; confidence=high
Rice	`Os02g0194000` (OsCHB702) - identity=48; qcov=0.702; evalue=1.38e-98; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF04433 (SWIRM); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995250

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776450.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776450.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776450.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776450.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776450.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55300536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:55301320`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C31,C49
`Chr1:55301320`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C31,C49
`Chr1:55301324`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C31,C49
`Chr1:55301324`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C31,C49
`Chr1:55301331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C49
`Chr1:55301332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C49
`Chr1:55301334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:55302098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:55302629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:55302657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776450.1

457 aa

228

457

SWIRM

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF04433 SWIRM 68-146 aa PF00249 Myb_DNA-binding 229-273 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 232-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776450.1`	Pfam	`PF04433`	SWIRM	Domain	68	146	1.1e-26	93.6	SWIRM domain
`XP_057776450.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	229	273	8e-14	52.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057776450.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	232	273	3.2e-09	37.6	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920467.1
AAACTTCTACTAACATTATTTCAGAGCAGTACCTTACGATAAAGTGCAAAAAAAAAAAATCTTAGAATATTATGGTACAGTGTGCTATTCTCTCTATTTGATAGCTCACAAATGCTAATATATATATTTACAGGGCTCTAACTGCAAATTTCCCTATTAATTTTAACGGTGATTGTCTCTAGTTTTTTTAGTAATTAATAAAATAATGGCCGCTGAAACGACGCCGCCTCCCAAATCCTCGTCCTCTGAACCCTCTCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995250
ATGGCCGCTGAAACGACGCCGCCTCCCAAATCCTCGTCCTCTGAACCCTCTCCCGCCACGCCGGCGGCTACCGCCGCCGACCGTCCGCCTCCTTCCGCCGCCACCTCCATCACCACCCCCACGGCTCCGTCCGCCGTTACTTCCCGCCTCGGCGAATCCGACGCCGACGTTATTCACATTCCCAGCTATTCTCGGTGGTTTTCGTGGAACGCCGTTCATGAATGCGAGGCTAGATTCCTACCGGAGTTCTTCGACGGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776450.1
MAAETTPPPKSSSSEPSPATPAATAADRPPPSAATSITTPTAPSAVTSRLGESDADVIHIPSYSRWFSWNAVHECEARFLPEFFDGRSPSKNPKIYKYYRNAIIRRYRENPSRKITFTEMRKTIVGDVGSIRRVFDFLEAWGLINYAGSTSRPQLKWEEKETKSAGGGADVAVAKKRVCSGCKTPCTIACFASEKHDMTLCARCYVRGNYRVGLNSSDFKRVEISEEAKSDWSDKETLQLLEAVMHYGDDWKKVAEHVSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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