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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004687`

染色体: Chr07 坐标: 59810896-59813311 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004687`
名称	SmilChr07G004687
描述	SPX domain-containing protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59810896 - 59813311 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995254`
GeneID	`130995254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995254`
原始查询	`LOC130995254`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SPX domain-containing protein 1-like
产物	SPX domain-containing protein 1-like
Arabidopsis	`AT2G26660` (SPX2) SPX domain-containing protein 2 (SPX2) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817207] identity=50.7; qcov=1.01; evalue=7.78e-86; confidence=high
Rice	`Os06g0603600` (OsSPX1) - identity=51.4; qcov=0.993; evalue=3.59e-80; confidence=high
GO	GO:0016036 (cellular response to phosphate starvation)
KEGG	-
Pfam	PF03105 (SPX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776453.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776453.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057776453.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776453.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59811316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C5
`Chr7:59811334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr7:59811426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:59811515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B1,B108,B13
`Chr7:59812338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C21,C7
`Chr7:59812988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:59813098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B70,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776453.1

284 aa

142

284

SPX

PF03105 SPX 123-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776453.1`	Pfam	`PF03105`	SPX	Domain	123	172	1.3e-16	62.3	SPX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920470.1
GATATGCGCATATTCCCGCCTTCATAAAAAACTGCCGAATATTCTCTCTCATTTTAGGCGATTCCGCCTATACATACACTCCGGTTATGTTTATGTATATATACCCGCGCACTGCCACCACCGCCTCCTCCTCCGCTTTCCGGTGATCCACTCTGCTGAAATCGAGATGAAGTTCTGGAAGATTCTGAGGAAGCTGCTGGATGAGATTTTTCCGGATTGGCAGGATAAGTTTATATCATACAAGGATTTGAAGAAGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995254
ATGAAGTTCTGGAAGATTCTGAGGAAGCTGCTGGATGAGATTTTTCCGGATTGGCAGGATAAGTTTATATCATACAAGGATTTGAAGAAGCAGCTCAATTCGATCTCTCCGCCGGAGAAACCGCCGGAAGATGTTGCGGATGGAGACGATGAGCGGTCGAAGAAGCGGCAGAGATTGGGAGACGATCGGGTCGATGAGGAGGGGAGAGAGGTGACGAAGGAGATGAAGGATTTTGTGATGCTTTTGGAAGGGGAGATTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776453.1
MKFWKILRKLLDEIFPDWQDKFISYKDLKKQLNSISPPEKPPEDVADGDDERSKKRQRLGDDRVDEEGREVTKEMKDFVMLLEGEIKKFNGFFMDKEEEYIITLKLLEDEVAEAKDLKEELMKVGRKLVDFHGEMILLENYSALNYTGLLKILKKYDKKSGDLIRLPFIQKVLHEPFYRTDVINKLVKECETMIIRIFQRHEELAPVEDTDLPEGCSDQPAVNEEAGKLVVPEELAEIKSMENMYLKLTISALRTMKEIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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