当前解析结果
SmilChr07G004705| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004705 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004705 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004705 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 59931458 - 59933295 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995274 |
|---|---|
| GeneID | 130995274 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995274 |
| 原始查询 | LOC130995274 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0578300; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0578300; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT5G39380 (AT5G39380)Plant calmodulin-binding protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833934] identity=52.8; qcov=0.24; evalue=3.81e-06; confidence=weak |
| Rice | Os12g0578300- identity=65.6; qcov=0.213; evalue=9.45e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995274 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057776489.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057776489.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776489.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776489.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776489.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:59931604 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,C4,C55 |
Chr7:59932085 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B133,B27,B57,C33 |
Chr7:59932089 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,C11 |
Chr7:59932110 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B56,B85,B96,C42,C71 |
Chr7:59932118 |
CGA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B56,B85,B96,C42,C71 |
Chr7:59932118 |
CGA |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B56,B85,B96,C42,C71 |
Chr7:59932312 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B138,B22,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。