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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004734`

染色体: Chr07 坐标: 60197016-60199824 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004734`
名称	SmilChr07G004734
描述	60S ribosomal protein L2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60197016 - 60199824 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995295`
GeneID	`130995295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995295`
原始查询	`LOC130995295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L2, mitochondrial-like
产物	60S ribosomal protein L2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`ATMG00560` (rpl2) - identity=47.3; qcov=0.97; evalue=5.05e-70; confidence=high
Rice	`gene-rpl2-2` - identity=58; qcov=0.26; evalue=2.65e-20; confidence=weak
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome)
KEGG	-
Pfam	PF00181 (Ribosomal_L2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057776517.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057776517.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776517.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776517.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776517.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60197332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B76,B89
`Chr7:60197339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:60197361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:60197392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:60197415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:60197420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C21
`Chr7:60197423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:60197733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr7:60197760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B117,C33
`Chr7:60197783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B117,C33
`Chr7:60197936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr7:60198096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776517.1

338 aa

169

338

Ribosomal_L2_N

PF00181 Ribosomal_L2_N 67-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776517.1`	Pfam	`PF00181`	Ribosomal_L2_N	Domain	67	105	1.1e-08	35.7	Ribosomal Proteins L2, RNA binding N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920534.1
ATTTAAAATCAATAGCGCAACGCCGCGCCGCTACTCTTCACAAAAATTTCTCCCTCAAGCTGCTTCTTCTTCTTCTTCTTTATTTCTCGTCGGCGCTTTTGATCGTTAAACACACTACGTCATGTCCGCCGCCGCTAGAACAGTCTTCCGTTCCGTCTCTACGTCCGCTCGCAGTGCCACGGCGAGACTATCCGCCTCCATTTTCAGGTCTCCTGTAGAGACGAGCAGTTTTAGCGATGCTTCGATTTCGCCGCACCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995295
ATGTCCGCCGCCGCTAGAACAGTCTTCCGTTCCGTCTCTACGTCCGCTCGCAGTGCCACGGCGAGACTATCCGCCTCCATTTTCAGGTCTCCTGTAGAGACGAGCAGTTTTAGCGATGCTTCGATTTCGCCGCACCGCGGTCAATTCGGGAATGTAGATGGAAGAAACTTCTCAACGAAGACGAGGAGATTTCGATTTGAGCGCAGAATCGATCTGAAACGAAGCACTTCGGCCACTGGAATCGTGGAAAGGATAGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776517.1
MSAAARTVFRSVSTSARSATARLSASIFRSPVETSSFSDASISPHRGQFGNVDGRNFSTKTRRFRFERRIDLKRSTSATGIVERIEYDPNRTSRIALVRWEGGELQRKSNAAEDFTLPAKSLESTAAPASGAFAFSSLPGLVDDRSADYSSIGEKKQTTKSKYVTVGVPSSSKSRFTIEGSGSKITSAKDVFVSAFSTKAKGENAGSSDGFPRIAVAGSRPAFFVLGEKEEVGGKDTFSLGEVQKWKKDSSRWMHRIKRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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