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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001595`

染色体: Chr07 坐标: 13255764-13259544 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001595`
名称	SmilChr07G001595
描述	probable pectin methylesterase CGR3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13255764 - 13259544 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995304`
GeneID	`130995304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995304`
原始查询	`LOC130995304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectin methylesterase CGR3
产物	probable pectin methylesterase CGR3
Arabidopsis	`AT5G65810` (CGR3) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836710] identity=63; qcov=0.985; evalue=8.04e-117; confidence=high
Rice	`Os01g0144000` - identity=57.9; qcov=0.992; evalue=6.4e-103; confidence=high
GO	GO:0008168 (methyltransferase activity); GO:0045488 (pectin metabolic process)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057776524.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057776524.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776524.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776524.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776524.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13256098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,B93
`Chr7:13256109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B42,B43
`Chr7:13256111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr7:13256173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C8
`Chr7:13256608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:13257182`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A21,B125,B132,B24,B93,C48,C56,C83,D6
`Chr7:13257185`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A21,B125,B132,B24,C48,C56,C83,D6
`Chr7:13257228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13257231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:13257269`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A21,B125,B132,B24,B93,C48,C56,C57,C75,C83
`Chr7:13257270`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A21,B125,B132,B24,C48,C56,C57,C75,C83
`Chr7:13257277`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A21,B125,B132,B24,C48,C56,C83

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920541.1
ATTAAACTTGTAAAAAGTGTATGTTGATCCAGCTGAGTGAAGACATGCACGCTTTTACGCATAAGATTCCCAATTTCAAACATCACTGCTAAATTCAACATCCAAACCACAACGACAAACTGTGTTTTCTCCTTTATCCATTTTAACCAACAAACAGTTACTCAAGATTCTGCACCTGCATTTTCATCCCTTTCCTTTTCCTCATTTCCCCCTCTACTTCTCACTGTGCCGCGATTCAATTCCCATCTCTCAATACATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995304
ATGGCATCAAGAAGGCCAATAAATCCTTCTAGGCGCATATCAGAAACTGGTGCAGTTTTGTCTTCGTCTTCGTTGCAGTCAAGATCCCGCTCCCCCTCTTATTTGTCTATTGCGCTCATTGTGGGGGCACTCTTTGTGATTGGTTATCTCTATCGCGGCCAAGGTGCTTTTGGAAATCCTAAAGCTCTGAATCGTGTGGAAGGTGATGTTTCATGCACTGTAGAAGTTGAACGTGCCATTCCAATTCTAAAAAAAGCATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776524.1
MASRRPINPSRRISETGAVLSSSSLQSRSRSPSYLSIALIVGALFVIGYLYRGQGAFGNPKALNRVEGDVSCTVEVERAIPILKKAYGDSMLKVLHVGPETCSVVSRLIKEDGTEAFGVEPYDVEDADEACKRLVHKGLVRVADIKFPLPYRAKSFPLVIVSDALDYLSPRYLNRSLPALTRLSSEGLVIFTGYPRNQRAKSVDKAKYGRAAKLRSSTWWIRFFLQMSLEENEAVSKKFEQAAAKRSFTSNCQIFHLKSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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