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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001596`

染色体: Chr07 坐标: 13260964-13264672 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001596`
名称	SmilChr07G001596
描述	probable xyloglucan glycosyltransferase 9
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13260964 - 13264672 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995305`
GeneID	`130995305`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995305`
原始查询	`LOC130995305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan glycosyltransferase 9
产物	probable xyloglucan glycosyltransferase 9
Arabidopsis	`AT4G07960` (CSLC12) Cellulose-synthase-like C12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826301] identity=75.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0510800` (OsCslC7) - identity=73.3; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00535 (Glycos_transf_2); PF13506 (Glyco_transf_21); PF13632 (Glyco_trans_2_3); PF13641 (Glyco_tranf_2_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995305

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057776525.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057776525.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776525.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776525.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776525.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13261409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C8
`Chr7:13261537`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	166	A1,A11,A14,A15,A16,A19,A21,A4,A5,A6,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B122,B123,B126,B127,B128,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B51,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B69,B71,B74,B75,B76,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B90,B91,B94,B96,B98,B99,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C20,C22,C26,C27,C29,C3,C31,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C58,C59,C61,C62,C63,C64,C67,C69,C7,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr7:13261564`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	170	A1,A11,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A24,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B122,B123,B126,B127,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B15,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B3,B31,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B40,B41,B43,B47,B5,B51,B53,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B69,B71,B73,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B90,B93,B94,B95,B96,B99,C1,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C26,C27,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C58,C59,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C69,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D5,D7,D8
`Chr7:13261566`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	170	A1,A11,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A24,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B122,B123,B126,B127,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B15,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B3,B31,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B40,B41,B43,B47,B5,B51,B53,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B69,B71,B73,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B90,B93,B94,B95,B96,B99,C1,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C26,C27,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C58,C59,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C69,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D5,D7,D8
`Chr7:13261607`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	128	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B105,B108,B11,B110,B111,B115,B123,B124,B126,B128,B130,B131,B133,B135,B137,B139,B19,B20,B21,B22,B23,B27,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B4,B43,B46,B47,B5,B52,B55,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B69,B71,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B84,B86,B9,B91,B92,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C13,C14,C18,C2,C20,C22,C25,C27,C28,C33,C34,C35,C39,C4,C40,C43,C45,C5,C51,C56,C57,C61,C62,C64,C65,C69,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D3,D7,D8
`Chr7:13261631`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	128	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B105,B108,B11,B110,B111,B115,B123,B124,B126,B128,B130,B131,B133,B135,B137,B139,B19,B20,B21,B22,B23,B27,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B4,B43,B46,B47,B5,B52,B55,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B69,B71,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B84,B86,B9,B91,B92,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C13,C14,C18,C2,C20,C22,C25,C27,C28,C33,C34,C35,C39,C4,C40,C43,C45,C5,C51,C56,C57,C61,C62,C64,C65,C69,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D3,D7,D8
`Chr7:13261802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C37
`Chr7:13261946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A6,B40,B83,C29
`Chr7:13261958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B83,C29
`Chr7:13261970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B83,C29
`Chr7:13261973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B83,C29
`Chr7:13262293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776525.1

689 aa

344

689

Glyco_tranf_2_3

Glyco_transf_21

Glycos_transf_2

Glyco_trans_2_3

PF13641 Glyco_tranf_2_3 231-464 aa PF13506 Glyco_transf_21 231-516 aa PF00535 Glycos_transf_2 236-374 aa PF13632 Glyco_trans_2_3 325-533 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776525.1`	Pfam	`PF13641`	Glyco_tranf_2_3	Domain	231	464	1.3e-16	61.7	Glycosyltransferase like family 2
`XP_057776525.1`	Pfam	`PF13506`	Glyco_transf_21	Domain	231	516	9.1e-17	61.7	Glycosyl transferase family 21
`XP_057776525.1`	Pfam	`PF00535`	Glycos_transf_2	Domain	236	374	4.5e-12	46.9	Glycosyl transferase family 2
`XP_057776525.1`	Pfam	`PF13632`	Glyco_trans_2_3	Domain	325	533	7.9e-22	78.7	Glycosyl transferase family group 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920542.1
GCTAAAAGTCAGTAAATTTATTTATTTTCTTTGAAAATAAAAGGGTGGTGATTCTTGGCTGATAGCAGAAGCAGAGTGTTAAAAATATTTTAGTGTAAATGATTCAAGAGAATTTCCAATTTCTCTTTATACTGTGGAATCTCAAAATCAAAGACGTGTTGAGCTGTTCTCTCTCTCTTTCTCACTAAATTTGAAAAAATATGTATAGGTGCAAGCTGTAAATGCATGTAGCGTATGAATGTATAGGACCTTTTTTTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995305
ATGGCACCGTGGTGGGGGAAGGAATCTCACAGAGGCACGCCGGTGGTGGTGAAAATGGAGAACCCTAACAACTGGTCAATGGTGGAGATAGAGTCGCCGTCCGAAGAAGACTTTTTAAACGGCGCCGTGTCGAAGGGCGGGCGCAACAAGAACGCCAAGCAGCTCACGTGGGTCATCCTGCTCAGGGCCCACAAGGCCGCCGGCTGCCTCGCCTCCATCGCCGCCGCATACGTCTCCCTCGCCGCCATCGTCCGCCGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776525.1
MAPWWGKESHRGTPVVVKMENPNNWSMVEIESPSEEDFLNGAVSKGGRNKNAKQLTWVILLRAHKAAGCLASIAAAYVSLAAIVRRRIASGRTDSADAAPAENPKIKSRFYTTIKAVLGFSLLLLAFELAAYLKGWHFGAPDLQLGRFYAGFTARDVFGLLYSSWVRIRVGYIAPPLQFLTSACIVLFIIQSVDRLILCLGCFWIKLKNIKPVAKQDLVDAESGDGDGYFPMVLVQIPMCNEKEVYQQSIAAVCEMEWPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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