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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001603`

染色体: Chr07 坐标: 13380400-13389616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001603`
名称	SmilChr07G001603
描述	uncharacterized SmilChr07G001603
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13380400 - 13389616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995310`
GeneID	`130995310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995310`
原始查询	`LOC130995310`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=35.1; qcov=0.48; evalue=2.65e-28; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776531.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057776531.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057776531.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057776531.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776531.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13384183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B34,B89,C34
`Chr7:13384184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr7:13384193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:13384403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C66
`Chr7:13384424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B59,B76,B78,B90,C40
`Chr7:13384426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B44,B8,C47
`Chr7:13384426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B8,C47
`Chr7:13384429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B82,B86
`Chr7:13384433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A14,B83,B84
`Chr7:13384468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A19,A2,A21,B115,B136,B38,B41,B68,B71,B76,B85,B94,C39
`Chr7:13384484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B68,C16,C6,C9
`Chr7:13384487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,C32,C55,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776531.1

350 aa

175

350

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 49-211 aa PF03732 PEG10_N-capsid 50-128 aa

XP_057776532.1

350 aa

175

350

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 49-211 aa PF03732 PEG10_N-capsid 50-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776531.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	49	211	4.2e-08	33.6	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057776531.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	50	128	1.4e-14	54.9	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057776532.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	49	211	4.2e-08	33.6	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057776532.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	50	128	1.4e-14	54.9	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920549.1
AAAACTAGTAAATGCAATTTTTTATAAATGAATCCAGTTTATGGTTCTGATTTTTTTATCAGAGGCAGAGTTATTATTTTAGCGTTATATTTTTATAACGTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCGACGAGGATTATTGAGCAATCAATAATTATTATTTCCAAGTTATAACTGACTTAGCAAAGTCATGTTATTTATTAATCGAGAAACAGAAGCAGTTATATTTTATTAGTGCTACTAGAAGTCGAGAAATTAT...

XM_057920548.1
AAAACTAGTAAATGCAATTTTTTATAAATGAATCCAGTTTATGGTTCTGATTTTTTTATCAGAGGCAGAGTTATTATTTTAGCGTTATATTTTTATAACGTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCGACGAGGATTATTGAGCAATCAATAATTATTATTTCCAAGTTATAACTGACTTAGCAAAGTCATGTTATTTATTAATCGAGAAACAGAAGCAGTTATATTTTATTAGTGCTACTAGAAGTCGAGAAATTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995310
ATGCCGCCTAAGAGAGGACGTCCTGCGAGAAACAATAACCATCGCAGAAACCGTAACGCTGTACCCGAAGAACCACAAGATGCTCGAGGACATAACCCATCCCCTCCGCCCCCAACTAGGAGAGTCGAAGAACTCTTTTTAAGGCAAAATCCACCTACGTTTGACGGAACGAGTGAACCGGCTGAAGCTGAGATTTGGGTGCGTGCAATGGAACGCATTTTCAACTTCCTACGTTGTACTGATGAGGAGCGCCTATCTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776531.1
MPPKRGRPARNNNHRRNRNAVPEEPQDARGHNPSPPPPTRRVEELFLRQNPPTFDGTSEPAEAEIWVRAMERIFNFLRCTDEERLSCVSFQLTGSADFWWEARRKILTPEQWAIYTWEDFKTGLYDKYIPKSYRKKKEAEFYELKQGKKSVVEYDKEFCNLSRFAPQQVDTDEKMAEKFCAGLRYEIKMALASHGGLSYTESLNRALDIEAAMPSDKSAPPLISTPNDQPVASHTLKGKRKWDNNEDNINQTSKKVWQEK...

XP_057776532.1
MPPKRGRPARNNNHRRNRNAVPEEPQDARGHNPSPPPPTRRVEELFLRQNPPTFDGTSEPAEAEIWVRAMERIFNFLRCTDEERLSCVSFQLTGSADFWWEARRKILTPEQWAIYTWEDFKTGLYDKYIPKSYRKKKEAEFYELKQGKKSVVEYDKEFCNLSRFAPQQVDTDEKMAEKFCAGLRYEIKMALASHGGLSYTESLNRALDIEAAMPSDKSAPPLISTPNDQPVASHTLKGKRKWDNNEDNINQTSKKVWQEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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