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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001614`

染色体: Chr07 坐标: 13543418-13544910 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001614`
名称	SmilChr07G001614
描述	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13543418 - 13544910 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995319`
GeneID	`130995319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995319`
原始查询	`LOC130995319`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
产物	protein SOB FIVE-LIKE 5-like
Arabidopsis	`AT4G33800` (AT4G33800) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829522] identity=34.8; qcov=0.799; evalue=7.13e-09; confidence=low
Rice	`Os04g0352200` - identity=54; qcov=0.347; evalue=1.71e-06; confidence=low
GO	GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF30936 (SOFL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776546.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776547.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057776547.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776546.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13543587`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	130	A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A23,A24,A7,A8,B1,B10,B103,B105,B107,B110,B112,B113,B114,B115,B12,B120,B122,B127,B13,B130,B131,B133,B135,B137,B139,B15,B19,B2,B20,B21,B24,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B5,B52,B55,B56,B57,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B70,B71,B76,B77,B78,B82,B83,B84,B86,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B98,C10,C12,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C26,C27,C29,C3,C31,C38,C4,C42,C48,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C59,C61,C62,C63,C64,C66,C7,C70,C73,C77,C79,C8,C81,C84,C86,C87,C9,D1,D2,D4,D5,D8
`Chr7:13543600`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A25,B102,B37,B75,B82,B91,C47,C60,C79
`Chr7:13543708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:13543965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C16
`Chr7:13544163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776546.1

157 aa

157

SOFL

PF30936 SOFL 7-85 aa

XP_057776547.1

144 aa

144

SOFL

PF30936 SOFL 7-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776546.1`	Pfam	`PF30936`	SOFL	Family	7	85	1.9e-08	35.6	SOB FIVE-LIKE
`XP_057776547.1`	Pfam	`PF30936`	SOFL	Family	7	89	1.8e-08	35.7	SOB FIVE-LIKE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920564.1
CACTTTATGTAAATTGTTGTTGTGCCAACAACTAAACTTGTTTCCTTTTCCGAATCATTTGTTTCTCTCTCTGTGTCTCTCAGATTCTGCTTTTTTCTTGTAAATCCCAAGAACACTAGCTCCTGTCCTTTGAAAGTTGGACAGCTTGAGTTGAAAATAATTGGTGTGGTAAATTTAGAAATTAGCTAGGATGTAATGATGTGAATGGAGAGGAGTCACACTTACTTGGTTTTTTTATACGAATGAATCGGTTAGCCAGC...

XM_057920563.1
GGAAGAAGGGAAGGGAAGCTCTCCCCACAATGACCAAGACAACTGGCAACTTTGATTCTTCTGGAATCAGATATATAATATTGAGCTAAAGGATAGAGCCAAGGACAAAAAATAGTCTAGGATTTGAGTCTGATTTATTTGGTCTCACATACCCCTTCCCCTTCCCCTTCCCCTTCCCCTTATAAATACATACAAACAACACCAAAACACCCCTTAATTCTCTCTCTCTCTCTACAATGAACGCATCAACCTCCGACTAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995319
ATGAACGCATCAACCTCCGACTACAGCAGCGGCTGCGAATCGGGCTGGACTATGTACTTGGATCAAATCTCCAATTCGGATGCCTTGTACACCAAGTATCAAGACAAGGGGGGCTACCACGACGACGACGACGACGAAGATCAGTCGATGGTGTCGGATGCATCGTCGGGGCCGCCGCCGCTGCCTCACGCGTCTGAAGATAAGAAGAAAAGAGCAGACACCAAGACCAGAAAGGAGCCTAACCAGAAGCACGCGCTCTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776546.1
MNASTSDYSSGCESGWTMYLDQISNSDALYTKYQDKGGYHDDDDDEDQSMVSDASSGPPPLPHASEDKKKRADTKTRKEPNQKHALCLDDTASSSIFHFSQDNVPPSDDSAAHFEGESVTKKRLSFFKSSTKGKSGNFLEEIYCWFDENNVYICVCV

XP_057776547.1
MNASTSDYSSGCESGWTMYLDQISNSDALYTKYQDKGGYHDDDDDEDQSMVSDASSGPPPLPHASEDKKKRADTKTRKEPNQKHALCLDDTASSSIFHFSQDNVPPSDDSAAHFEGESVTKKRLSFFKSSTKGKSGSVVGRKRQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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