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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001620`

染色体: Chr07 坐标: 13600982-13603404 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001620`
名称	SmilChr07G001620
描述	F-box protein At3g12350
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13600982 - 13603404 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995325`
GeneID	`130995325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995325`
原始查询	`LOC130995325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At3g12350
产物	F-box protein At3g12350
Arabidopsis	`AT3G12350` (AT3G12350) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820413] identity=47.4; qcov=0.982; evalue=4.62e-133; confidence=high
Rice	`Os12g0511000` (OsFbox656) - identity=38.6; qcov=0.757; evalue=3.41e-66; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0009740 (gibberellic acid mediated signaling pathway); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776555.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776555.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776555.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776555.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13601446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13601463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:13601464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C45,C55
`Chr7:13601524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:13601683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B91
`Chr7:13601758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C5,C85,D11
`Chr7:13601922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C39
`Chr7:13601974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B7
`Chr7:13601999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C31
`Chr7:13601999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:13602920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C5
`Chr7:13603006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776555.1

445 aa

222

445

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 12-40 aa PF12937 F-box-like 13-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776555.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	12	40	1.6e-06	28.5	F-box domain
`XP_057776555.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	13	56	2.8e-09	37.3	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920572.1
TATTCTGCCATAGGTTCCGCGGAGATCATTTCCAGCTTGATGTGAAAATACAGTAGTACCCCTTTCAGCTGAGAGCCCCCCATTTCCAGATTTCTGCAGACGGAAAAACAACTTTCATAAACTCCACCATTTTCGCTTCTTCCACATTCTTCGTCCAATCAAAATCATCTATATTCCTACAATTTCAATCTCTTATCCGAGATTCAAGAATCGTTGCACTCACTTGTGGAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTTTGATTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995325
ATGATTGAAACATTGATTCCATTGTCGTTCGGCGATTTCCCGGACGACGTGCAGCTCTGCGTGCTGTCGTTCCTCCGCCCCGCCGACCTAGCGGCGTTCGCCTGCACCTGCAAGCGTTTCGACGCCCTCTACCGCCACGACCAGCGCCTCTGGTTCTCCCTCTGCCACCGCCGATGGGGGTCCAAAACCCTAATCAACAAATGGGGCGGCGGCAAGATCTCCTACAAGCACCTCTACCGCGTCCTCCACGAGTACGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776555.1
MIETLIPLSFGDFPDDVQLCVLSFLRPADLAAFACTCKRFDALYRHDQRLWFSLCHRRWGSKTLINKWGGGKISYKHLYRVLHEYDTLIGFWRRCGDAAASAPPLVFFEWGPFYITGSRVSPSKNRGYGVIKKPYLWMSIAPSGEMINYLDPDGKAELTAEDLMAESGVVESELIQVNVNFIGDCHVVVEENLGVSTNGSATDPSSPDLRGEECDNVYGSPPDRLMTEIYQCLANRTSPGGNGSSRRQRRREKEKQKQGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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