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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001632`

染色体: Chr07 坐标: 13691507-13693448 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001632`
名称	SmilChr07G001632
描述	protein SLOW WALKER 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13691507 - 13693448 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995335`
GeneID	`130995335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995335`
原始查询	`LOC130995335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SLOW WALKER 1
产物	protein SLOW WALKER 1
Arabidopsis	`AT2G47990` (SWA1) transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819411] identity=55.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0224900` (OsWD40-138) - identity=51.2; qcov=1.02; evalue=8.75e-171; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0045943 (positive regulation of transcription by RNA polymerase I)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF09384 (UTP15_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776564.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057776564.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776564.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776564.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776564.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13691952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C39
`Chr7:13692022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13692060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B136
`Chr7:13692316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B61,B77,C72
`Chr7:13692341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr7:13692386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C83
`Chr7:13692527`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr7:13692527`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr7:13692530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:13692565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B123
`Chr7:13692610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13692616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776564.1

528 aa

264

528

WD40

UTP15_C

PF00400 WD40 121-159 aa PF00400 WD40 164-202 aa PF00400 WD40 213-244 aa PF09384 UTP15_C 379-520 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776564.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	121	159	1.6e-23	82.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057776564.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	164	202	1.6e-23	82.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057776564.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	213	244	1.6e-23	82.8	WD domain, G-beta repeat
`XP_057776564.1`	Pfam	`PF09384`	UTP15_C	Family	379	520	3.2e-38	131.5	UTP15 C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920581.1
TACTATGTGTGCAAAGCAAAAGAAATCGGAGTATATATATATCCGGTCGTAAACCCTAAATTCCTCTTTCAGCAGCAATCCTCCTCCACTTCCCCAAACCCTAAAACCCCTAGCACCCGCTCTTACGCCGTTTAACAATGGCGGAAGCGTTCCCGGTTAAGCCGAAGCTTCGCCCCACCTCCAGTAAAGTCACTCCAACGCCGGAGGCCAAGTACTGGAGATCATTCAAAATCCCTAAAGATATCGAAACCACACCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995335
ATGGCGGAAGCGTTCCCGGTTAAGCCGAAGCTTCGCCCCACCTCCAGTAAAGTCACTCCAACGCCGGAGGCCAAGTACTGGAGATCATTCAAAATCCCTAAAGATATCGAAACCACACCATCAAAATCCTTCACTTTCCCAATAAATTCGATTGCATTTTCGCCGATAGGCCCTCACGATTTCGCCGCCACGCATTCCGCCAACATATCGATCTTCTCCGGCAAGACCCTTGAGCCTAAACCCACAATCTCCTCTTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776564.1
MAEAFPVKPKLRPTSSKVTPTPEAKYWRSFKIPKDIETTPSKSFTFPINSIAFSPIGPHDFAATHSANISIFSGKTLEPKPTISSFSDTAAAVSFRCDGKLLAAGDLTGTVHVFDAKSRSHLRRLKGHAAAVRSVNYPRAADKLHLFSGGDDSVVKYWDVTIEKCVFNLLGHKDYVRCGDASPISDEMFVSGSYDHSVRVWDVRVSNASSVMELNHEKPVESVIYLPSGGLIATAGGNFVKIWDVIGGGKLLYSMESHIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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