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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001635`

染色体: Chr07 坐标: 13749995-13751012 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001635`
名称	SmilChr07G001635
描述	histone H2AX
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	13749995 - 13751012 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995338`
GeneID	`130995338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995338`
原始查询	`LOC130995338`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H2AX
产物	histone H2AX
Arabidopsis	`AT1G54690` (GAMMA-H2AX) gamma histone [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841910] identity=90.1; qcov=1.01; evalue=8.85e-87; confidence=high
Rice	`Os12g0530000` - identity=93.4; qcov=0.858; evalue=5.63e-75; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00125 (Histone); PF00808 (CBFD_NFYB_HMF); PF16211 (Histone_H2A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776571.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057776571.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057776571.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776571.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776571.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:13750181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:13750369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C62
`Chr7:13750726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:13750841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:13750908`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr7:13750908`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776571.1

141 aa

141

Histone

CBFD_NFYB_HMF

Histone_H2A_C

PF00125 Histone 16-95 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 31-94 aa PF16211 Histone_H2A_C 98-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776571.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	16	95	1.8e-14	54.6	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057776571.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	31	94	2.9e-05	25.0	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone
`XP_057776571.1`	Pfam	`PF16211`	Histone_H2A_C	Family	98	130	3.8e-19	68.8	C-terminus of histone H2A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920588.1
TAACAGCACTCGTACATTACTATCCAAAAACTCTCTCAAAAATCACTCGATTCAAATCTCCTCTTCTTAGGGTTTCCAAGACACCAATCGCCGCCCCGGGAAAATGAGTTCCAACGCCGCAGCCACCACCAAGGGGGGAAGAGGCAAGCCAAAGGCTTCCAAATCCGTCTCCCGCTCGTCGAAAGCCGGTCTCCAGTTTCCCGTTGGCAGAATCGCGCGTTTTCTCAAGGCTGGTAAATACGCGGAGCGTGTCGGCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995338
ATGAGTTCCAACGCCGCAGCCACCACCAAGGGGGGAAGAGGCAAGCCAAAGGCTTCCAAATCCGTCTCCCGCTCGTCGAAAGCCGGTCTCCAGTTTCCCGTTGGCAGAATCGCGCGTTTTCTCAAGGCTGGTAAATACGCGGAGCGTGTCGGCGCCGGCGCCCCTGTCTATCTCTCCGCCGTCCTTGAGTACCTCGCCGCCGAGGTGTTGGAGCTTGCTGGAAATGCTGCTAGAGACAACAAGAAGAACAGGATTGTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776571.1
MSSNAAATTKGGRGKPKASKSVSRSSKAGLQFPVGRIARFLKAGKYAERVGAGAPVYLSAVLEYLAAEVLELAGNAARDNKKNRIVPRHIQLAVRNDEELSKLLGHVTIANGGVLPNIHQTLLPKKAGGRDKEIGSASQEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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