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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001690`

染色体: Chr07 坐标: 14317138-14319754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001690`
名称	SmilChr07G001690
描述	60S ribosomal protein L19-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14317138 - 14319754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995386`
GeneID	`130995386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995386`
原始查询	`LOC130995386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L19-1-like
产物	60S ribosomal protein L19-1-like
Arabidopsis	`AT3G16780` (AT3G16780) Ribosomal protein L19e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820931] identity=84.5; qcov=1; evalue=2.4e-126; confidence=high
Rice	`Os03g0579300` - identity=90; qcov=0.944; evalue=4.24e-118; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01280 (Ribosomal_L19e); PF25476 (Ribosomal_L19e_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776638.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776639.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057776639.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776638.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14319127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B83
`Chr7:14319141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A16,A19,A25,A7,B10,B104,B118,B121,B123,B132,B29,B32,B36,B44,B45,B51,B6,B69,B72,B73,B83,B85,B90,B91,B92,B95,C10,C15,C17,C21,C22,C37,C38,C39,C41,C60,C61,C67,C7,C74,C86,D11,D6,D7,D9
`Chr7:14319165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B36,C38,C39,C86
`Chr7:14319203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B128,B59
`Chr7:14319339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr7:14319342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776638.1

220 aa

110

220

Ribosomal_L19e

Ribosomal_L19e_C

PF01280 Ribosomal_L19e 4-54 aa PF25476 Ribosomal_L19e_C 56-146 aa

XP_057776639.1

213 aa

106

213

Ribosomal_L19e

Ribosomal_L19e_C

PF01280 Ribosomal_L19e 4-54 aa PF25476 Ribosomal_L19e_C 56-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776638.1`	Pfam	`PF01280`	Ribosomal_L19e	Domain	4	54	2.5e-28	98.5	Ribosomal protein L19e, N-terminal domain
`XP_057776638.1`	Pfam	`PF25476`	Ribosomal_L19e_C	Domain	56	146	5.3e-35	120.3	Ribosomal protein L19e, C-terminal domain
`XP_057776639.1`	Pfam	`PF01280`	Ribosomal_L19e	Domain	4	54	2.3e-28	98.6	Ribosomal protein L19e, N-terminal domain
`XP_057776639.1`	Pfam	`PF25476`	Ribosomal_L19e_C	Domain	56	146	4.9e-35	120.4	Ribosomal protein L19e, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920656.1
AAAATTAGAGAGAAACGTAAATCAAAGCCCAATCATATCTCAAAAACCCTAAGGGCAGAATCGAGCGGAGTATAAATAGCATTTCTCCTCTACTCGTTTTTCCTCCATTCGCTCGCCTCGTTCATCTAGACACACAGAAATGGTGTCACTGAAGCTACAGAAGCGGCTCGCCGCCAGCGTGCTCAAGTGCGGCAAGGGCAAGGTCTGGCTTGACCCTAATGAAGTTAACGAAATCTCCATGGCTAACTCTCGACAAAACA...

XM_057920655.1
TATCTCAAAAACCCTAAGGGCAGAATCGAGCGGAGTATAAATAGCATTTCTCCTCTACTCGTTTTTCCTCCATTCGCTCGCCTCGTTCATCTAGACACACAGAAATGGTGTCACTGAAGCTACAGAAGCGGCTCGCCGCCAGCGTGCTCAAGTGCGGCAAGGGCAAGGTCTGGCTTGACCCTAATGAAGTTAACGAAATCTCCATGGCTAACTCTCGACAAAACATCAGGAAACTGGTCAAGGATGGATTCATTATCAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995386
ATGGTGTCACTGAAGCTACAGAAGCGGCTCGCCGCCAGCGTGCTCAAGTGCGGCAAGGGCAAGGTCTGGCTTGACCCTAATGAAGTTAACGAAATCTCCATGGCTAACTCTCGACAAAACATCAGGAAACTGGTCAAGGATGGATTCATTATCAGGAAGCCCACCAAGATTCATTCACGATCCCGTGCTCGTCGAATGAAAGAGGCCAAGAGGAAGGGTCGTCACTCTGGATATGGTAAAAGAAAGGGTACCAGGGAGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776638.1
MVSLKLQKRLAASVLKCGKGKVWLDPNEVNEISMANSRQNIRKLVKDGFIIRKPTKIHSRSRARRMKEAKRKGRHSGYGKRKGTREARLPTKILWMRRMRVLRRLLRKYREAKKIDKHMYHDMYMKVKGNVFKNKRVLMESIHKSKAEKAREKTLSDQFEAKRAKNKASRERKFARREERLAQVQLFVEYLFPCLSNSMDWNMCPAVSIFCRCITHLRVV

XP_057776639.1
MVSLKLQKRLAASVLKCGKGKVWLDPNEVNEISMANSRQNIRKLVKDGFIIRKPTKIHSRSRARRMKEAKRKGRHSGYGKRKGTREARLPTKILWMRRMRVLRRLLRKYREAKKIDKHMYHDMYMKVKGNVFKNKRVLMESIHKSKAEKAREKTLSDQFEAKRAKNKASRERKFARREERLAQGPGEKVAPPPAAAAPVPVSQPAQGAKKAKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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