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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003712`

染色体: Chr01 坐标: 55462679-55467521 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003712`
名称	SmilChr01G003712
描述	chaperone protein dnaJ 10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55462679 - 55467521 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995397`
GeneID	`130995397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995397`
原始查询	`LOC130995397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 10
产物	chaperone protein dnaJ 10
Arabidopsis	`AT1G21080` (AT1G21080) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838704] identity=72.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0493800` (OsDjC70) - identity=70.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF14308 (DnaJ-X)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776654.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776654.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776654.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776654.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776654.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55463327`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr1:55463327`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr1:55464721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:55466990`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B117
`Chr1:55466990`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776654.1

389 aa

194

389

DnaJ

DnaJ-X

PF00226 DnaJ 6-68 aa PF14308 DnaJ-X 133-319 aa

XP_057776661.1

389 aa

194

389

DnaJ

DnaJ-X

PF00226 DnaJ 6-68 aa PF14308 DnaJ-X 133-319 aa

XP_057776668.1

389 aa

194

389

DnaJ

DnaJ-X

PF00226 DnaJ 6-68 aa PF14308 DnaJ-X 133-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776654.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	6	68	1e-26	93.5	DnaJ domain
`XP_057776654.1`	Pfam	`PF14308`	DnaJ-X	Domain	133	319	1.4e-54	185.4	X-domain of DnaJ-containing
`XP_057776661.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	6	68	1e-26	93.5	DnaJ domain
`XP_057776661.1`	Pfam	`PF14308`	DnaJ-X	Domain	133	319	1.4e-54	185.4	X-domain of DnaJ-containing
`XP_057776668.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	6	68	1e-26	93.5	DnaJ domain
`XP_057776668.1`	Pfam	`PF14308`	DnaJ-X	Domain	133	319	1.4e-54	185.4	X-domain of DnaJ-containing

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920671.1
CCCGTGGCCTATGCGCTATTCGCCTATTTCTTACCTAAAATATTGCTAGCATGATAGACTTATAGATTTCCTGCTGTTATTTCTCTAGTAATTTAAAAATATTATTTTTATCTATGATACATATGAGATTATTCCGTCTCTTCAGAGACATACGCGTAATGAAAATTGTTGATTTTTTCTTAATATTATAGATAGATTATCAAGTAAAAGAAAATTGTTGGTTGTTTCTTACAAAGGTAGTACAAAGCAAAAAAGCGTAC...

XM_057920678.1
TTTCTTACCTAAAATATTGCTAGCATGATAGACTTATAGATTTCCTGCTGTTATTTCTCTAGTAATTTAAAAATATTATTTTTATCTATGATACATATGAGATTATTCCGTCTCTTCAGAGACATACGCGTAATGAAAATTGTTGATTTTTTCTTAATATTATAGATAGATTATCAAGTAAAAGAAAATTGTTGGTTGTTTCTTACAAAGGTAGTACAAAGCAAAAAAGCGTACAAATTTCTTACATCAGTCATTTTAGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130995397
ATGGTGAAGGAGACCGAATACTATGATGTGTTGGGTGTGAGCCCCACGGCCACTGAGGCCGAGATTAAGAAAGCTTATTATGTCAAGGCTAGGCAAGTTCATCCGGACAAAAATCCAAATGATCCTAATGCAGCACATAAGTTTCAGATTTTGGGTGAAGCTTATCAAGTTCTGAGTGACCCATCACAGAGGCAAGCTTATGATGCTCATGGGAAATCAGGAATTTCTACAGATTCAATTATCGATCCTGCTGCAATCTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057776654.1
MVKETEYYDVLGVSPTATEAEIKKAYYVKARQVHPDKNPNDPNAAHKFQILGEAYQVLSDPSQRQAYDAHGKSGISTDSIIDPAAIFAMLFGSELFEEYIGQLAMASMASMDVFTEGEELDTKKLQEKMRSVQKEREEKLAGILKDRLNVYVQGNKQEFIRHAEAEVARLSNAAYGVDMLSTIGYIYARQAAKELGKKVMYLGVPFIAEWFRNKGHFIKSQVTAATGAIALIQLQEDMKKQLSAEGNYTEEELEEYMQSH...

XP_057776661.1
MVKETEYYDVLGVSPTATEAEIKKAYYVKARQVHPDKNPNDPNAAHKFQILGEAYQVLSDPSQRQAYDAHGKSGISTDSIIDPAAIFAMLFGSELFEEYIGQLAMASMASMDVFTEGEELDTKKLQEKMRSVQKEREEKLAGILKDRLNVYVQGNKQEFIRHAEAEVARLSNAAYGVDMLSTIGYIYARQAAKELGKKVMYLGVPFIAEWFRNKGHFIKSQVTAATGAIALIQLQEDMKKQLSAEGNYTEEELEEYMQSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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