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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001709`

染色体: Chr07 坐标: 14491351-14491944 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001709`
名称	SmilChr07G001709
描述	gamma-glutamylcyclotransferase 2-2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14491351 - 14491944 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995402`
GeneID	`130995402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995402`
原始查询	`LOC130995402`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gamma-glutamylcyclotransferase 2-2-like
产物	gamma-glutamylcyclotransferase 2-2-like
Arabidopsis	`AT4G31290` (AT4G31290) ChaC-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829256] identity=68.2; qcov=0.717; evalue=7.72e-24; confidence=medium
Rice	`Os02g0465900` (OsARP) - identity=60.9; qcov=0.75; evalue=2.01e-17; confidence=low
GO	GO:0003839 (gamma-glutamylcyclotransferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006751 (glutathione catabolic process); GO:0061928 (glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04752 (ChaC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776655.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057776655.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057776655.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776655.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14491457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B15,B78,C38
`Chr7:14491484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B50,B53
`Chr7:14491489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:14491495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B93,C33
`Chr7:14491503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:14491748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C81
`Chr7:14491764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:14491779`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C52
`Chr7:14491779`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C52
`Chr7:14491782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:14491787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B68,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776655.1

92 aa

ChaC

PF04752 ChaC 4-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776655.1`	Pfam	`PF04752`	ChaC	Family	4	45	1.5e-05	25.8	ChaC-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920672.1
TTGCTCATTGCCCATTAAATCTCAATTCTTGGTGCTTTTTTTGCTGAAACTGAAAGCATTGTTGCTTTGTGAATTTGCAGATTCACATCAACCCCTGAAAAAATATCGAATAAGTATTATCTAGGGCGGCCCCTTTGGAGGAGATGGACGGGCAAATCGCGACGGCCTTTGGCCCCTGCGGCAACAATAGGGACTACCTTTTCTTGCTGGAGAAGGCCATGTTTGATATTGGTCATGAAGATGACTACGTTATCGAGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995402
ATGGACGGGCAAATCGCGACGGCCTTTGGCCCCTGCGGCAACAATAGGGACTACCTTTTCTTGCTGGAGAAGGCCATGTTTGATATTGGTCATGAAGATGACTACGTTATCGAGCTAGCTAACGAGGTAAGGAAGGTGCTTCTGAATCTCAGCGGTTTGCTCAAGGAAAACAAGTTGTCGAGTTTGTCGCCACTGAAAATGAAGGCTTCGCCTGGGGCAATCGCCATGGATTTGAGGGTGGTCGGTGCCGGCGACTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776655.1
MDGQIATAFGPCGNNRDYLFLLEKAMFDIGHEDDYVIELANEVRKVLLNLSGLLKENKLSSLSPLKMKASPGAIAMDLRVVGAGDFAGGGGD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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