Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001734`

染色体: Chr07 坐标: 14732124-14735102 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001734`
名称	SmilChr07G001734
描述	receptor-like protein kinase ANXUR2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14732124 - 14735102 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995422`
GeneID	`130995422`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995422`
原始查询	`LOC130995422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein kinase ANXUR2
产物	receptor-like protein kinase ANXUR2
Arabidopsis	`AT5G28680` (ANX2) Malectin/receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832975] identity=54.4; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0280700` (YK11) - identity=54.5; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004714 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995422

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776676.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776676.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776676.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776676.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14732279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,C14,C39,C72,C73
`Chr7:14732347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:14732381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C16
`Chr7:14732446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C16
`Chr7:14732549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B128,B34,C50
`Chr7:14732556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:14732557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr7:14732597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:14732645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B52,B98,C55
`Chr7:14732649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:14732678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C27
`Chr7:14732744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C16,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776676.1

892 aa

446

892

Malectin_like

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF12819 Malectin_like 48-415 aa PF00069 Pkinase 546-811 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 548-811 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776676.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	48	415	7.3e-26	91.9	Malectin-like domain
`XP_057776676.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	546	811	1.8e-44	152.9	Protein kinase domain
`XP_057776676.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	548	811	7.6e-47	160.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920693.1
TTCTACCAAGAAATGGTCGACCTCAAATTCATAACAGCAAATTAGAAAAGACGAAGTGAAATTTCAACAAGAAAAAGAAAACAAAAAACAAAACAAGAAGTAGAAAAACAAAGGCGTACAGGAAAATCAGAAATCCAAAATTCTTGTTTCCTGTATGCCAAAATTTTCTCGCTCATGTTTTCACGCAGCCATGGTTGTTAAATATTATAATCATGCCATTATTAATCTCCTTCTGTCTCTAGCAACCATTTTCCTTATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995422
ATGCCAAAATTTTCTCGCTCATGTTTTCACGCAGCCATGGTTGTTAAATATTATAATCATGCCATTATTAATCTCCTTCTGTCTCTAGCAACCATTTTCCTTATCTCTCACACATCACACGCACAGGACAGACCTTTAATTCTCAATTGTGGCTCCCCAAGCTCTGCCAAAGATGCCGACGGTCGCTTCTGGGATCCCGATGACAAATTCTTGGCTGCCGACACAAAATTCGTCATCGCGAGAGCCGATGTTCAAGACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776676.1
MPKFSRSCFHAAMVVKYYNHAIINLLLSLATIFLISHTSHAQDRPLILNCGSPSSAKDADGRFWDPDDKFLAADTKFVIARADVQDPSLPSEVPYMTARIFQSEAKYQFPLKDSTSRTMLRLHFYPSSYPNFNISNSYFAVVAGGVTLLSNFSAYISAEALSQAYFIKEFFLAPSQSATLDVTFKPSGPQSFAFVNGIEVMPVPAIFNSDPALAGTVGAGMDATGATTVPISDSSMETMFRLNVGGRYISPVNDSDGLMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器