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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001740`

染色体: Chr07 坐标: 14768453-14771874 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001740`
名称	SmilChr07G001740
描述	peptide chain release factor 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14768453 - 14771874 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995427`
GeneID	`130995427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995427`
原始查询	`LOC130995427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide chain release factor 1, mitochondrial
产物	peptide chain release factor 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G47020` (AT2G47020) Peptide chain release factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819316] identity=72.2; qcov=0.857; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0277300` - identity=76.5; qcov=0.815; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006415 (translational termination); GO:0016149 (translation release factor activity, codon specific)
KEGG	-
Pfam	PF00472 (RF-1); PF03462 (PCRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057776686.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057776686.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057776686.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776686.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14768601`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A13,A20,A23,A4,A7,B1,B118,B135,B140,B18,B19,B2,B23,B24,B3,B30,B32,B33,B47,B49,B53,B54,B60,B62,B7,B73,B75,B77,B84,B86,B9,B99,C1,C20,C22,C23,C33,C46,C5,C54,C74,C76,C79,C80,C82,C84,C85,D6,D7
`Chr7:14768626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:14768627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:14768702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:14768765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:14768920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B8,B84,D4
`Chr7:14769160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B8,B84,D4
`Chr7:14769258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:14771358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776686.1

428 aa

214

428

PCRF

RF-1

PF03462 PCRF 80-272 aa PF00472 RF-1 279-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776686.1`	Pfam	`PF03462`	PCRF	Domain	80	272	2.9e-61	207.4	PCRF domain
`XP_057776686.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	279	389	8.8e-43	145.7	RF-1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920703.1
AGTGGAGAATTTATATTGACAAGAGAAATTCGTATTTAAGTGGTTTGATTTAAAGAAGGAAAGGTGAAATTTGTTCAACGGAGCAGGATGAGCAGACGAGCAAGATTTTGGAAATTGAAACTCCATGAATCTCAGTCTCGTTTCTTCAAAAGCCCCATTAATATTTCCCGGCCGCCGGAGCACCGCCGTAACCACCTATTACTCACTGCACAAACACTCTTCCGTCGTCTCTACTCCGCCAGAGCTGCACTGTCCCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995427
ATGAGCAGACGAGCAAGATTTTGGAAATTGAAACTCCATGAATCTCAGTCTCGTTTCTTCAAAAGCCCCATTAATATTTCCCGGCCGCCGGAGCACCGCCGTAACCACCTATTACTCACTGCACAAACACTCTTCCGTCGTCTCTACTCCGCCAGAGCTGCACTGTCCCAATCCCAGCCCCAACCCCAGCTTTCTAACGATCTGATCAACATCATGGAGCAGAAACTATCGGCTATAGAAAACCGACATTCTCATTTAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776686.1
MSRRARFWKLKLHESQSRFFKSPINISRPPEHRRNHLLLTAQTLFRRLYSARAALSQSQPQPQLSNDLINIMEQKLSAIENRHSHLVAILNQPDASPEEYSTANKELKKLRHTIDVVAELRKKQQEIGGLKSLIDEAEEDKDMREMAAEELGQASQEEERLRYMLLKSLLPKDDVDERDCILEVRAGTGGEEASLFAMDIFKMYEKYSQKKGWRFEVLGVAESDVKGYKEASAAISGADVYGKLKFESGIHRVQRVPVTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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