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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003710`

染色体: Chr01 坐标: 55455077-55458590 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003710`
名称	SmilChr01G003710
描述	AP-1 complex subunit sigma-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55455077 - 55458590 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995429`
GeneID	`130995429`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995429`
原始查询	`LOC130995429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-1 complex subunit sigma-1
产物	AP-1 complex subunit sigma-1
Arabidopsis	`AT2G17380` (AP19) associated protein 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816245] identity=90.7; qcov=1; evalue=2.86e-110; confidence=high
Rice	`Os03g0783700` - identity=92.5; qcov=1; evalue=6.22e-112; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0030117 (membrane coat); GO:0030121 (AP-1 adaptor complex); GO:0035615 (clathrin-cargo adaptor activity); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995429

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057776691.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057776691.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057776691.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776691.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057776691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55457948`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C50
`Chr1:55457948`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776691.1

161 aa

161

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 1-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776691.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	1	140	1.8e-55	187.5	Clathrin adaptor complex small chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920708.1
GAATAAATTATAAAATTAATCGATTGAACTTTTTTGAAGTTGGACCCAGATAAAATTTATTGGGCCAAAACTAGATTTCCAATAGAGATGAAGGACTAACTTGTAATTCTTTTTCGATCAACAAATTGCGAATAGAAATTTATAAAATCATAAAGACAGACAAAATATGTAAAAAGAAGACGGTTGGGAACAGCTGAGGCATTTGGATCAGACCTCCGACTGAAACTCCGACGACCTGCCGCCGCCGCCATGATCCACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995429
ATGATCCACTTTGTTCTTCTTATTAGCAGACAAGGGAAAGTAAGGTTGACAAAATGGTACTCACCATATACTCAAAAGGAAAGGACAAAGGTTATCCGGGAGCTTAGTGGTATGATTCTCACTCGAGCCCCTAAGTTGTGTAACTTTGTGGAATGGAGGGGATACAAAGTTGTTTACAAAAGGTATGCTAGCCTTTATTTCTGCATGTGCATTGACCAGGATGATAATGAATTGGAGGTCCTTGAAATTATCCATCATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776691.1
MIHFVLLISRQGKVRLTKWYSPYTQKERTKVIRELSGMILTRAPKLCNFVEWRGYKVVYKRYASLYFCMCIDQDDNELEVLEIIHHYVEILDRYFGSVCELDLIFNFHKAYYILDEILIAGELQESSKKTVARLIAAQDSLVEAAKEQASSISNMIAQATK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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