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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001797`

染色体: Chr07 坐标: 15346676-15349129 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001797`
名称	SmilChr07G001797
描述	plant intracellular Ras-group-related LRR protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15346676 - 15349129 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995484`
GeneID	`130995484`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995484`
原始查询	`LOC130995484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant intracellular Ras-group-related LRR protein 3-like
产物	plant intracellular Ras-group-related LRR protein 3-like
Arabidopsis	`AT1G12970` (PIRL3) plant intracellular ras group-related LRR 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837855] identity=56.9; qcov=0.93; evalue=7.66e-124; confidence=high
Rice	`Os04g0476700` (OsIRL3) - identity=54.8; qcov=0.785; evalue=4.76e-99; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995484

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776765.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776765.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057776765.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776765.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15347251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C71
`Chr7:15347383`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B4,B67,B75,B78,B81,C4,C82,D6
`Chr7:15347407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B99,C27,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776765.1

344 aa

172

344

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_4

PF13855 LRR_8 51-106 aa PF00560 LRR_1 73-93 aa PF00560 LRR_1 95-114 aa PF13855 LRR_8 95-152 aa PF00560 LRR_1 118-139 aa PF13855 LRR_8 211-270 aa PF00560 LRR_1 236-257 aa PF12799 LRR_4 236-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	51	106	2.2e-29	101.7	Leucine rich repeat
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	73	93	4.5e-18	62.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	95	114	4.5e-18	62.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	95	152	2.2e-29	101.7	Leucine rich repeat
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	118	139	4.5e-18	62.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	211	270	2.2e-29	101.7	Leucine rich repeat
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	236	257	4.5e-18	62.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057776765.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	236	269	5e-23	81.3	Leucine Rich repeats (2 copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920782.1
GGTACCTGAAATAAAATATGGTTTCCAGTAATATTTACCATATTATAAAGAACGAAGCTATGAAAATACCGAAGTATGAATGGCAAAATATTTTAATCTGTTACTATATGAAAGTCAACAAACCAAACCAATTTCAGTGCACCTAAAATTCCCATTTTCACAGTGCACCAATTTCTCACAATATGTGTGGAATTATAGTTGATTAAGCACTAAGAAAAGACAAATGGAGACGGATTTTGTGGATATACAGTTGGGTGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995484
ATGGAGACGGATTTTGTGGATATACAGTTGGGTGACGATGTCGTTGACGACGGAGACGTCGAAGATGAAGACGAAGGTCAAGAATTCGAAGGTGTGAATGAGGAGGTTGTTAGGGTTTTACGAGAAGCCCTCCACGATGATAGGGTTGTGGAAAGAGTTGACCTCTCCGGCCGCCACCTCAAATTTCTGCCTGAGCCCTTTGGCAAGATTCATGCACTCCTCCTTCTCGATGTCTCCCACAATCAACTCCAGATTATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776765.1
METDFVDIQLGDDVVDDGDVEDEDEGQEFEGVNEEVVRVLREALHDDRVVERVDLSGRHLKFLPEPFGKIHALLLLDVSHNQLQIIPDSISGLQKLEELNVSSNLLETLPDAIGLLVNLKVLNVSSNKLKKLPESLAGCRSLIELDAGFNDLMFLPKNIGYGLVNLQKLSLHLNKLKAFPNSICEMRSLKILDAHFNSLHSLPHAIGRLTKLEVLNVSSNFTDLVQVPESIGDLINLRELDLSNNQIRAIPESIYQLERL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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