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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001824`

染色体: Chr07 坐标: 15730231-15730853 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001824`
名称	SmilChr07G001824
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase XERICO
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	15730231 - 15730853 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995510`
GeneID	`130995510`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995510`
原始查询	`LOC130995510`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase XERICO
产物	probable E3 ubiquitin-protein ligase XERICO
Arabidopsis	`AT1G24580` (AT1G24580) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745762] identity=55; qcov=1.18; evalue=5.7e-37; confidence=medium
Rice	`Os08g0492500` (OsRHP1) - identity=31; qcov=1.31; evalue=2.09e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995510

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057776798.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057776798.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057776798.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776798.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:15730600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:15730620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:15730706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B18,B31,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776798.1

111 aa

111

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-C3HC4

PF17123 zf-RING_11 65-93 aa PF13639 zf-RING_2 65-108 aa PF00097 zf-C3HC4 70-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776798.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	65	93	8.8e-07	29.2	RING-like zinc finger
`XP_057776798.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	65	108	7.8e-13	49.2	Ring finger domain
`XP_057776798.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	70	107	4.2e-05	24.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920815.1
GGTTTGTTCACAATTTCTGAGTGTGCTGCCATTTGTAAAAGAATACCAACTCCCATTGAGTTTCAAATTTGGAAATAATTAACACTAATATATTTAGACATGGGGCTGTCGAATTTTCCTAGCCCAGCGGAAGGGGTGCTGCCGCTGCTAGTGATGAACACGGTGATGTCGGTGGCTCTGGTGAAGAACAAGCTGAGATCAGTGCTGCAAGCGGTGGGCGGCGGCGGCGCGGCGGAGGAGGCGAGGAGGGTGTCGATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995510
ATGGGGCTGTCGAATTTTCCTAGCCCAGCGGAAGGGGTGCTGCCGCTGCTAGTGATGAACACGGTGATGTCGGTGGCTCTGGTGAAGAACAAGCTGAGATCAGTGCTGCAAGCGGTGGGCGGCGGCGGCGCGGCGGAGGAGGCGAGGAGGGTGTCGATCACGCGCTACGGTTGTCTATGTAGAGAGGCGGTGGAGTGCTGTGTGTGTTTGTGTAAATTTGAGGCGGAGGAGGAAGTGAGTGAGCTTTCTTGCAAGCATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776798.1
MGLSNFPSPAEGVLPLLVMNTVMSVALVKNKLRSVLQAVGGGGAAEEARRVSITRYGCLCREAVECCVCLCKFEAEEEVSELSCKHFFHKPCLDKWFDNQHITCPLCRSIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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