当前解析结果
SmilChr07G001847| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001847 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001847 |
| 描述 | sucrose nonfermenting 4-like protein |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 15986068 - 15988775 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995531 |
|---|---|
| GeneID | 130995531 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995531 |
| 原始查询 | LOC130995531 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | sucrose nonfermenting 4-like protein |
| 产物 | sucrose nonfermenting 4-like protein |
| Arabidopsis | AT1G09020 (SNF4)sucrose nonfermenting-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837423] identity=60.2; qcov=0.946; evalue=1.88e-29; confidence=medium |
| Rice | Os03g0856400 (OsCBSX8)- identity=62.1; qcov=0.71; evalue=3.52e-25; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995531 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057776834.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057776834.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057776834.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776834.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776834.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:15987225 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,C25,C56 |
Chr7:15987254 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B127,B64 |
Chr7:15987571 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,C23,C33,D1 |
Chr7:15987573 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B15,C31,C79,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
7 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。