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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001851`

染色体: Chr07 坐标: 16032483-16034018 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001851`
名称	SmilChr07G001851
描述	probable pectate lyase 5
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16032483 - 16034018 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995536`
GeneID	`130995536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995536`
原始查询	`LOC130995536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectate lyase 5
产物	probable pectate lyase 5
Arabidopsis	`AT1G67750` (AT1G67750) Pectate lyase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843100] identity=85.3; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0137201` (OsPLL4.2) - identity=74.9; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030570 (pectate lyase activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00544 (Pectate_lyase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057776841.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057776841.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776841.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776841.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776841.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16032873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A7,B51,C44,C80
`Chr7:16032927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr7:16032932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:16033031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B95
`Chr7:16033122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B2,B98,C48
`Chr7:16033389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B131,B56,C72
`Chr7:16033458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:16033470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776841.1

401 aa

200

401

Pectate_lyase_4

PF00544 Pectate_lyase_4 135-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776841.1`	Pfam	`PF00544`	Pectate_lyase_4	Repeat	135	333	6.1e-21	75.6	Pectate lyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920858.1
ACTCACACACACTCTAACAAAACAACACAAACTTTCCACCTTTTTATTTTCATTAATTCCTTTTTCCCAACATAAACATGGGAATTCGAATTCTCATAGTCATGCTACTTCCATTATTAGCTCCTAAATTCACATTCTCTTCACCAGTTGCTGACCCTGAGCTCGTAGTACAAGAAGTTAATGAGAAAATCAATGCATCACGAAGGAAGCTAGGGTTCCTATCGTGCGGGACAGGGAACCCCATCGACGACTGCTGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995536
ATGGGAATTCGAATTCTCATAGTCATGCTACTTCCATTATTAGCTCCTAAATTCACATTCTCTTCACCAGTTGCTGACCCTGAGCTCGTAGTACAAGAAGTTAATGAGAAAATCAATGCATCACGAAGGAAGCTAGGGTTCCTATCGTGCGGGACAGGGAACCCCATCGACGACTGCTGGCGGTGCGACCCCAATTGGGAAAAGAACCGGCAGCGGCTGGCCGACTGCGCCATCGGGTTCGGCAAGCACGCGATCGGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776841.1
MGIRILIVMLLPLLAPKFTFSSPVADPELVVQEVNEKINASRRKLGFLSCGTGNPIDDCWRCDPNWEKNRQRLADCAIGFGKHAIGGRDGKIYVVTDSGDHAVNPQPGTLRYGVIQKEPLWIIFARDMVIRLKQELMLNSFKTIDGRGASVHIAGGACITVQYVTNVIIHGLNIHDCKQGGNAYVRDSPDHYGWRTVSDGDGVSIFGGSHVWVDHCSLSNCRDGLIDAIHGSTAITISNNYLTHHNKVMLLGHSDTYKQD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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