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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001855`

染色体: Chr07 坐标: 16076869-16082438 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001855`
名称	SmilChr07G001855
描述	uncharacterized SmilChr07G001855
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16076869 - 16082438 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995540`
GeneID	`130995540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995540`
原始查询	`LOC130995540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP1-interacting protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833693]; symbol=CIP4; hit=AT5G37190; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	COP1-interacting protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833693]; symbol=CIP4; hit=AT5G37190; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G37190` (CIP4) COP1-interacting protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833693] identity=54.5; qcov=0.091; evalue=3.91e-23; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776844.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776844.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776844.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776844.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16077197`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B132,B51,C15,C17,C21
`Chr7:16077197`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B132,B51,C15,C17,C21
`Chr7:16078132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B131,B18,C2
`Chr7:16079121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B8,C3
`Chr7:16079204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:16079409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,D9
`Chr7:16079686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:16080378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B131,B18,C2
`Chr7:16080581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B129,B26,B64,C35
`Chr7:16080754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C72
`Chr7:16080757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C72
`Chr7:16080817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920866.1
TTAATTGATACTTGTAAGCCCCAATTGTGAAAGAAGACGTAAAATAAAACCCCAACCAAAACCCTCGAGACCGCGCTCCAGCGCCACCTTTGGAACGACAACCCTGCCTTGTTCAATGGCGAAACGACGCCGTGAGCTGGATTACGATGGCGCAGCTGCAGAAACGGCGGAGATCAACACAGTGTTCGTAGACACCAGCCTCGGCACGCACCTCGCCATACTCGTCTGCAGCTCTGATACAGCTTCGGACTTAAAAAAGA...

XM_057920865.1
TTAATTGATACTTGTAAGCCCCAATTGTGAAAGAAGACGTAAAATAAAACCCCAACCAAAACCCTCGAGACCGCGCTCCAGCGCCACCTTTGGAACGACAACCCTGCCTTGTTCAATGGCGAAACGACGCCGTGAGCTGGATTACGATGGCGCAGCTGCAGAAACGGCGGAGATCAACACAGTGTTCGTAGACACCAGCCTCGGCACGCACCTCGCCATACTCGTCTGCAGCTCTGATACAGCTTCGGACTTAAAAAAGA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130995540
ATGGCGAAACGACGCCGTGAGCTGGATTACGATGGCGCAGCTGCAGAAACGGCGGAGATCAACACAGTGTTCGTAGACACCAGCCTCGGCACGCACCTCGCCATACTCGTCTGCAGCTCTGATACAGCTTCGGACTTAAAAAAGAAGGTGGCCGTGGAGCATAAGCAATGCTTTCCGGAAATTGGTGAGATACAGATCCATTCTGTGAAGGTAAAACGCAGGTCAAGCTATTATCATCTGCCAGATAGTATGCTTGTTTG...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057776844.1
MAKRRRELDYDGAAAETAEINTVFVDTSLGTHLAILVCSSDTASDLKKKVAVEHKQCFPEIGEIQIHSVKVKRRSSYYHLPDSMLVWSAFHGIKRNWFLAIDASNVPICLSIRSSLELGTSSGVKTGMTDIDDDCRGFISDANKKDIISFALPDCAAEKNAVSELIAKPKVDHGGIYSEEHCMGTKSPLKKKRKVRHTKDVFHNSGLGNGDAMSRPNGKDVKPNMPDSIAKVSGMRNDQYGVEGRLVSEESYLLNVAEKG...

XP_057776845.1
MAKRRRELDYDGAAAETAEINTVFVDTSLGTHLAILVCSSDTASDLKKKVAVEHKQCFPEIGEIQIHSVKVKRRSSYYHLPDSMLVWSAFHGIKRNWFLAIDASNVPICLSIRSSLELGTSSGVKTGMTDIDDDCRGFISDANKKDIISFALPDCAAEKNAVSELIAKPKVDHGGIYSEEHCMGTKSPLKKKRKVRHTKDVFHNSGLGNGDAMSRPNGKDVKPNMPDSIAKVSGMRNDQYGVEGRLVSEESYLLNVAEKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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