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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003726`

染色体: Chr01 坐标: 55575070-55576725 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003726`
名称	SmilChr01G003726
描述	protein AUXIN-REGULATED GENE INVOLVED IN ORGAN SIZE-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55575070 - 55576725 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995546`
GeneID	`130995546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995546`
原始查询	`LOC130995546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein AUXIN-REGULATED GENE INVOLVED IN ORGAN SIZE-like
产物	protein AUXIN-REGULATED GENE INVOLVED IN ORGAN SIZE-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0046622 (positive regulation of organ growth)
KEGG	-
Pfam	PF28360 (ARGOS_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057776858.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057776858.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057776858.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776858.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55575349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr1:55575391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:55575523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776858.1

124 aa

124

ARGOS_helical

PF28360 ARGOS_helical 63-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776858.1`	Pfam	`PF28360`	ARGOS_helical	Domain	63	112	2.2e-16	60.3	ARGOS small helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092192.1
AAATATATTTGATATGAATGACTATTTTCCTTACATGACTTAATAAAATGTATATGTAATTAATTTTCAGCCATAAAATTTTACCTACGAGTACAAGATATGAAGCGCATAGTAAATGTACATCATATTGTCACACGAAAGCAAAAAGTGAGGCGAGAGTTAGAGAGAGAGAGGGGCCAGGGGAGAAGAACCAAAAAAATAAATGGAAAAAGGGTTTTCTCAAATTATTGTTAAAGATTTGAGTGATGAATATATTTCCT...

XM_057920875.1
GGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAAAGAGAGAGGTGAAATTTTGTTGAACAGAATTAAGCTGATAAAGAAGCTCGGGTCAATCTTGGCATACAAAAAAAATCATCTTTTTTGTTGGGCTTCCGGCGACGACGTCTTATGGTTCTACAATTGAAGATCAACAGTTGAAGATCACATTTTTAAGAGAGAGAGTTAGATATATATATATTTATAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGGATTTTAAATGAGTGCGGCGGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995546
ATGAGTGCGGCGGAGCAACGGCGATCGAGATTGGGAATGTGGGGAGAGGTAATGAATGTGGAAGATGATTACTCAAGGAAGATGATGACGATGAGGGGCAAGAATGGAATTTCACAGCAGCAGCAGCAGCAGAGGAAGAGCTTCTCGCAGTCGCAGCAGGGGCAAGGAGGTAAAATGCGGCGGTATTTCACGTTGGAGTCGGTGGTGCTGCTGGCTTGCCTGACGGTGTCGCTGCTGATTCTGCCGCTGGTGCTGCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776858.1
MSAAEQRRSRLGMWGEVMNVEDDYSRKMMTMRGKNGISQQQQQQRKSFSQSQQGQGGKMRRYFTLESVVLLACLTVSLLILPLVLPPLPPPPLLLLLLPILILGLLMLLAFMPSDARNATYTYV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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