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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001863`

染色体: Chr07 坐标: 16143949-16147072 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001863`
名称	SmilChr07G001863
描述	two-component response regulator ARR11-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16143949 - 16147072 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995550`
GeneID	`130995550`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995550`
原始查询	`LOC130995550`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ARR11-like
产物	two-component response regulator ARR11-like
Arabidopsis	`AT1G67710` (ARR11) response regulator 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843096] identity=51.5; qcov=0.548; evalue=2.38e-80; confidence=medium
Rice	`Os01g0904700` (RR26) - identity=54.7; qcov=0.539; evalue=9.49e-88; confidence=medium
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0003677 (DNA binding); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg); PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995550

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776863.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776863.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776863.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776863.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776863.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16144389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:16144655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:16144666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B135,B2,B98,C48
`Chr7:16146150`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A25,B102,B121,B131,B133,B137,B28,B77,B78,B81,B89,C18,C25,C27,C29,C34,C4,C46,C56,C63,C71,C82,C84,C87
`Chr7:16146153`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A25,B102,B121,B131,B133,B137,B28,B77,B78,B81,B89,C18,C25,C27,C29,C34,C4,C46,C56,C63,C71,C82,C84,C87
`Chr7:16146357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:16146363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:16146394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:16146485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,C22,C47,C67
`Chr7:16146665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B121,B133,C29,D11
`Chr7:16146691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776863.1

471 aa

236

471

Response_reg

Myb_DNA-binding

PF00072 Response_reg 22-130 aa PF00249 Myb_DNA-binding 185-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776863.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	22	130	6.7e-16	59.2	Response regulator receiver domain
`XP_057776863.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	185	235	3.1e-07	31.1	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920880.1
TCTCTCCCACTGAAATCTCGCACATCTATAGTAATCTGTTGATTCCGCTATATAGTAATCTCTCAAACCAAGTCGCTTTAATTTCTTTCTCTCTCCCTTATACACACCTCACACATTGATTCATAGGAGCAGACAAATCAAATGGTGTTGGGATCAAATAGTAGTACTGCTTTGCGGTCCGATTCTTTCCCTGCGGGTCTTCGGGTTCTCGTTGTCGATCACGATCCTGCCTACTTGAATATTCTTCACAAGATGCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995550
ATGGTGTTGGGATCAAATAGTAGTACTGCTTTGCGGTCCGATTCTTTCCCTGCGGGTCTTCGGGTTCTCGTTGTCGATCACGATCCTGCCTACTTGAATATTCTTCACAAGATGCTCCTCAAGTGCAAGTATGAAGTAAGCATGTGTAATTCAGCACAAGAATCATTGGATGTGCTTGGGAAACAAAAAGATGGATTTGATATAGTAATAAGTGATGCGAAGGTGGCGGACGTGGATGATTTCAACTTTTTGGAACAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776863.1
MVLGSNSSTALRSDSFPAGLRVLVVDHDPAYLNILHKMLLKCKYEVSMCNSAQESLDVLGKQKDGFDIVISDAKVADVDDFNFLEQVVHKMNIPVIVMSEDGDPSRMMKGVEHGACEYLQKPIRTRELRNIWQHVFRKRIHEIKCVEPKQDPTPHNSDANNIVIANKRKDHDNTTHDPTTLKKPRVVWTFDLHQKFVKAVNRVGLEKVGPKKILELMEVPWLTRENVASHLQKYRLYISRVQKENEVNAAACNEVKLSDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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