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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001867`

染色体: Chr07 坐标: 16172048-16174492 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001867`
名称	SmilChr07G001867
描述	protein HHL1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16172048 - 16174492 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995553`
GeneID	`130995553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995553`
原始查询	`LOC130995553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HHL1, chloroplastic
产物	protein HHL1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G67700` (AT1G67700) multidrug resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843095] identity=68.9; qcov=0.979; evalue=2.65e-116; confidence=high
Rice	`Os02g0600200` (OJ1791_B03.17-1) - identity=68.9; qcov=0.696; evalue=3.76e-80; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20133 (HHL1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776867.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057776867.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057776867.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776867.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16172510`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr7:16172510`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr7:16172515`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	B109,B114,B21,B42,B43,B59,B64,B72,B88,C24,C25,C26,C3,C36,C79,C85,D9
`Chr7:16172592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:16172628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:16173087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:16173773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:16174014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:16174086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776867.1

240 aa

120

240

HHL1-like

PF20133 HHL1-like 66-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776867.1`	Pfam	`PF20133`	HHL1-like	Family	66	202	1.1e-09	39.1	Protein HHL1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920884.1
AATTTATTGATATCCATATTTGCAAAACTATTAGTCAGATATGAGGAAATCCACAAAATATTAGAAATGACAAAAAACGAAAAATAGAAGGGAAAAAATTGTGGATAAGGCTTAGCCAGAAGGGCCCATCCATATTCCTTGCACTCAGCTTCCAGCAAGAAGCAGTAGAATCTTGTAAATTTAGAGAGAGAGAGAGTAGTGAGAAGGTTGTGGTTATGGAGGTAGCGATGTCTGTGAACCCAGTGGTGCGATTGCCCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995553
ATGGAGGTAGCGATGTCTGTGAACCCAGTGGTGCGATTGCCCTTATCCTCCCATGGAAGAATGCACGACGATTCAGTGATAAGACACTCACTGTTTACGACAAGAAGAGCAACCTCAACAAATCCAAAGCCTCATAGATTGATGGTAGTTGAAGCTAAAGGCAAGAAAGGAATGGCTTCTAGACAGTACCAGCGCACGCCCCCACCCCCTCTTCCCAAGCTTGAAGATGATGGCAACCCCAAGTTCGTCGTCTTCATTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776867.1
MEVAMSVNPVVRLPLSSHGRMHDDSVIRHSLFTTRRATSTNPKPHRLMVVEAKGKKGMASRQYQRTPPPPLPKLEDDGNPKFVVFIRMANVYLWYPLNIVTGGTTAKIMVAAKDNFLGKYIYKDTLARNLASVIYRDEKEIQKMAQKQFRVLRSATDFRYGYKLVENNNLRAALAANDVIELPRPEELKTVVDKVKDFFGEAKESFGKMTFLNTGDDSSEQEDTKEASIEKSKEKSPVKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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