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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001873`

染色体: Chr07 坐标: 16205718-16210475 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001873`
名称	SmilChr07G001873
描述	probable thimet oligopeptidase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16205718 - 16210475 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995561`
GeneID	`130995561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995561`
原始查询	`LOC130995561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable thimet oligopeptidase
产物	probable thimet oligopeptidase
Arabidopsis	`AT1G67690` (AT1G67690) Zincin-like metalloproteases family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843094] identity=59; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0902200` - identity=60.4; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0006518 (peptide metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01432 (Peptidase_M3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057776874.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057776874.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776874.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776874.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16205832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:16206908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:16207182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B67,B76,C76
`Chr7:16207200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B82
`Chr7:16207688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A22,B11,B36,B86,B88,B91,C2,C25,C77,D9
`Chr7:16207885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B59,B98,C54
`Chr7:16207922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A16,A18,A22,B126,B131,B136,B15,B16,B27,B34,B44,B47,B60,B66,B81,B84,B88,B95,C36,C47,C59,C69,C86,D9
`Chr7:16208074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr7:16208759`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A1,B138,B35,B78
`Chr7:16208759`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A1,B138,B35,B78
`Chr7:16208812`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	64	A14,A3,A5,B1,B108,B114,B124,B125,B127,B129,B130,B132,B137,B138,B18,B2,B24,B25,B32,B35,B39,B46,B49,B50,B54,B57,B59,B62,B65,B66,B67,B75,B76,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B90,B91,C11,C15,C2,C23,C28,C32,C35,C38,C45,C46,C48,C58,C68,C70,C78,C82,C83,C85,D10,D11,D3,D4,D7
`Chr7:16208817`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B33,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776874.1

699 aa

350

699

Peptidase_M3

PF01432 Peptidase_M3 255-694 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776874.1`	Pfam	`PF01432`	Peptidase_M3	Family	255	694	1.8e-94	318.4	Peptidase family M3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920891.1
GTTCAAGATTTTGAGCGGAACGGATTGAATCTTACCTCAACCAAGAAGGAGGAATTGCAACGTTTGAGGGCTCAAATAGATGAGCTAAGTATGCGATACATTCAAAATCTGAATGCTGATAGTACAGTTGTTCTTTTCAATGATATGGAGCTAGCTGGCTTGCCTCCAGAGTTCCTTAAGGGCTTGGATGTTGATGACAGTGGTAAATTCAAGGTTCTATTAAGAAGCCATCACGTGTCACCCATCTTAGAGTTATGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995561
GTTCAAGATTTTGAGCGGAACGGATTGAATCTTACCTCAACCAAGAAGGAGGAATTGCAACGTTTGAGGGCTCAAATAGATGAGCTAAGTATGCGATACATTCAAAATCTGAATGCTGATAGTACAGTTGTTCTTTTCAATGATATGGAGCTAGCTGGCTTGCCTCCAGAGTTCCTTAAGGGCTTGGATGTTGATGACAGTGGTAAATTCAAGGTTCTATTAAGAAGCCATCACGTGTCACCCATCTTAGAGTTATGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776874.1
MENQRKRRDRRNLIALTGAGALLAVSANLAINALKTHLRNRNRKVVPGSNVQTNLCASEILRLADNIVAKSKEIHDAVASVPLDKVTYANTILRLAELEAQQFPLIQSCAFPKLVSSSEDICKASIEAERRIDAHISICSQREDVYRVIKAFTARGEWMSSEVKRYAEYLVQDFERNGLNLTSTKKEELQRLRAQIDELSMRYIQNLNADSTVVLFNDMELAGLPPEFLKGLDVDDSGKFKVLLRSHHVSPILELCKVGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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