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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001876`

染色体: Chr07 坐标: 16238097-16242017 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001876`
名称	SmilChr07G001876
描述	F-box protein SKIP14-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16238097 - 16242017 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995564`
GeneID	`130995564`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995564`
原始查询	`LOC130995564`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP14-like
产物	F-box protein SKIP14-like
Arabidopsis	`AT3G26000` (AT3G26000) Ribonuclease inhibitor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822197] identity=40; qcov=1.01; evalue=8.72e-103; confidence=medium
Rice	`Os04g0485800` (OsFbox225) - identity=36.6; qcov=0.844; evalue=6.16e-78; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF28114 (At3g27290_F_box_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995564

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057776876.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776876.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776876.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776876.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776876.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16239031`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C38,C54
`Chr7:16239031`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C38,C54
`Chr7:16239042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B93,C48,C72
`Chr7:16239044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr7:16239081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:16239158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A19,A7,B30,B32,B84,C16
`Chr7:16239159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B93,C48,C72
`Chr7:16239185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C37
`Chr7:16239234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr7:16239316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:16239386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B93,C48,C72
`Chr7:16239437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776876.1

488 aa

244

488

F-box

F-box-like

At3g27290_F_box_C

PF00646 F-box 237-274 aa PF12937 F-box-like 237-279 aa PF28114 At3g27290_F_box_C 416-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776876.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	237	274	7.2e-05	23.3	F-box domain
`XP_057776876.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	237	279	2e-06	28.2	F-box-like
`XP_057776876.1`	Pfam	`PF28114`	At3g27290_F_box_C	Domain	416	487	6.4e-25	88.1	At3g27290 F-box protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920893.1
TTCAATCCGCAACCACCGCGAAAAACCAATTTTCGCCCCCACACGTGTCGGTCGCTCCCTATCCTACCTAAAATTGCACGCACACACACCCCCTGTTGCCCCCGACCTTCACTCCCCCCTCCTCCATTTCTCCTCCTCCAAGTCCAAGTAAATTTCCTTTTCTTCCCTTTCACCACTGTTCCACACTATTCATTCTCTTTCATACTTACATTGCAATTTTCTTTTTTCTAATTTTTTATTCTCCCAATTCATTTCATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995564
ATGGCCTTGAACTATTCACATAGGCTGGCCCCGGCACATATATCTGAAGATATTTTGGTGTCACTTGTGAGGATTATGAATGGGTATCTGGTGGAGTGTGTTTCTGAAAAGAATAGGGATGTCTACTTGAGACCATGGCATGTGAGCCGATTGGAATCTGATGAACTGAACTTTGGTTGTGAGAGGGACATAGTTGACTGTTGCAGCTCATCGGAACCAACCTCAATGGACATTGTTGACCGTTTGCCATCTGATCCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776876.1
MALNYSHRLVXPAHISEDILVSLVRIMNGYLVECVSEKNRDVYLRPWHVSRLESDELNFGCERDIVDCCSSSEPTSMDIVDRLPSDPFGMDIKTTFTAITGWLEDLEVDCEGYMRCNNGMSCQEGYGLFAGWNLIWNSSVKFQPFPRTIQLNERLGMGMQDYIPCDFQFDHQLDAALTLSTHEDEEGMRYGLAPYDVGFRSACDVGNVGFSNRSPSCSLDMGSAREVEGASEFEGAPHEAFNYVLSYLGVKDLLSIERVC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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