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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001879`

染色体: Chr07 坐标: 16259449-16261770 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001879`
名称	SmilChr07G001879
描述	polycomb group protein FIE2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16259449 - 16261770 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995571`
GeneID	`130995571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995571`
原始查询	`LOC130995571`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polycomb group protein FIE2-like
产物	polycomb group protein FIE2-like
Arabidopsis	`AT3G20740` (FIE) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821622] identity=70.5; qcov=0.889; evalue=3e-56; confidence=high
Rice	`Os08g0137100` (FIE2) - identity=77.5; qcov=0.881; evalue=3.67e-60; confidence=high
GO	GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0005515 (protein binding); GO:0031491 (nucleosome binding); GO:0035098 (ESC/E(Z) complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776891.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776891.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057776891.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057776892.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057776891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16259752`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	73	A15,A2,A21,A25,A5,A7,B1,B10,B103,B105,B114,B117,B119,B126,B127,B131,B132,B137,B14,B16,B20,B21,B34,B40,B43,B51,B52,B53,B57,B63,B7,B77,B8,B80,B87,B88,B89,B90,B93,B95,B99,C11,C14,C15,C17,C19,C21,C22,C26,C29,C39,C48,C49,C5,C52,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C69,C74,C77,C81,C85,C86,D10,D6,D7,D8,D9
`Chr7:16259803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C33
`Chr7:16259854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,D8
`Chr7:16259855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr7:16259870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr7:16259874`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr7:16259874`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr7:16259957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr7:16260050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:16260051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776892.1

126 aa

126

WD40

PF00400 WD40 99-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776892.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	99	121	4.7e-06	27.6	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920908.1
AAAGCAATACATATTGCAGCCTCCATAGTGATTCTCTCTCCTACGTGGCGCTCTCCCAAACCTCCATTTTGATTTATCTCATTCTCTATTCTGCCTTTTACGCCTCAATTCTTAAGCTTGGCAAAAACATCAAAATTCTCATACTCAAATACCGTTACAAAATTTGATTAGCAATTCATACGTAATTCATTCTCAAATCTATCACCATGTGTCTGCAAATCTCATGCTCAATCACCTGTTGTAGCAATTGATCAGCAGCA...

XM_057920909.1
CAGCCTCCATAGTGATTCTCTCTCCTACGTGGCGCTCTCCCAAACCTCCATTTTGATTTATCTCATTCTCTATTCTGCCTTTTACGCCTCAATTCTTAAGCTTGGCAAAAACATCAAAATTCTCATACTCAAATACCGTTACAAAATTTGATTAGCAATTCATACGTAATTCATTCTCAAATCTATCACCATGTGTCTGCAAATCTCATGCTCAATCACCTGTTGTAGCAATTGATCAGCAGCAAATCCTTCTAAAATCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995571
ATGTCCGCCGATCTGCCACCTCCCTTCCCCCATATGAGTGTTGATAATGAACTTGTACTATGGGAACCAAAAATGAAAGAACAATCTCCTGGAGAGGGTACGGTTGACATCCTCCAAAAGTATCCTGATCCCGAGTGTGATATTTGGTTTATCAAGTTTTCTTGTGATTTCCATTACAAGGCAGCAGCAGTAGGGAATAGGGAAGGGAAGATATATGTGTGGGAAGTTCAGTCTAACCCTCCGGTTCTCATTGCAAGATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776891.1
MSADLPPPFPHMSVDNELVLWEPKMKEQSPGEGTVDILQKYPDPECDIWFIKFSCDFHYKAAAVGNREGKIYVWEVQSNPPVLIARLSHVQSKSPIRLTAMSFDGRYELLIPLFFLSLIYTTLERVNHINPCGCSTILCCCEDGTIWRWDVVASS

XP_057776892.1
MSADLPPPFPHMSVDNELVLWEPKMKEQSPGEGTVDILQKYPDPECDIWFIKFSCDFHYKAAAVGNREGKIYVWEVQSNPPVLIARLSHVQSKSPIRLTAMSFDGSTILCCCEDGTIWRWDVVASS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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