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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001954`

染色体: Chr07 坐标: 16992781-16997792 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001954`
名称	SmilChr07G001954
描述	uncharacterized SmilChr07G001954
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	16992781 - 16997792 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995630`
GeneID	`130995630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995630`
原始查询	`LOC130995630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoribosylformylglycinamidine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839628]; symbol=AT1G27385; hit=AT1G27385; species=arabidopsis; confidence=high
产物	phosphoribosylformylglycinamidine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839628]; symbol=AT1G27385; hit=AT1G27385; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G27385` (AT1G27385) phosphoribosylformylglycinamidine synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839628] identity=57.2; qcov=1.05; evalue=2.16e-77; confidence=high
Rice	`Os04g0386500` - identity=60.9; qcov=0.873; evalue=1.26e-71; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04359 (DUF493)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776970.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057776970.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776970.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776970.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776970.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:16993712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,C28,C62
`Chr7:16994009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B18,C3
`Chr7:16994075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B62,C47,C63
`Chr7:16994085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C47,C63
`Chr7:16994088`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,C47
`Chr7:16994088`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B131,C47
`Chr7:16996753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:16996776`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	178	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B107,B108,B109,B110,B111,B115,B117,B119,B120,B124,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B28,B3,B30,B35,B36,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B70,B71,B73,B74,B76,B79,B80,B81,B86,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C84,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776970.1

206 aa

103

206

DUF493

PF04359 DUF493 122-189 aa

XP_057776971.1

205 aa

102

205

DUF493

PF04359 DUF493 122-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776970.1`	Pfam	`PF04359`	DUF493	Domain	122	189	2e-13	51.4	Protein of unknown function (DUF493)
`XP_057776971.1`	Pfam	`PF04359`	DUF493	Domain	122	205	5.4e-20	72.5	Protein of unknown function (DUF493)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092230.1
AAAAAAAAATAGTGGCAAGGGCGTTGATGTAGTTTTTGGTTAAGCAAAATTAGAGTGCTCGTCTCACGAATCACGAGTACACTGCAAAGAAGGGAAAACTAAAATTCTTAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCAACTTCAAAACACAAAATCCGGTACAGAAAAAAATACTTCAAAAATGGCGTGCAGGATTGCTCTCAGAACCGTCTTCCTAACTGAAACATGGATGCCTTTACCCTTCATTCATAACACTTT...

XR_009092231.1
AAAAAAAAATAGTGGCAAGGGCGTTGATGTAGTTTTTGGTTAAGCAAAATTAGAGTGCTCGTCTCACGAATCACGAGTACACTGCAAAGAAGGGAAAACTAAAATTCTTAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCAACTTCAAAACACAAAATCCGGTACAGAAAAAAATACTTCAAAAATGGCGTGCAGGATTGCTCTCAGAACCGTCTTCCTAACTGAAACATGGATGCCTTTACCCTTCATTCATAACACTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995630
ATGGCGTGCAGGATTGCTCTCAGAACCGTCTTCCTAACTGAAACATGGATGCCTTTACCCTTCATTCATAACACTTTATCCAGTTTTAGACCAATTAAGAAAATATCTACATCCAATCTAAGCTGTGGCTGCAAAATTGCAGCAAATTCTAAGAGCTGCCAGTTTTCACGTTATTGTTCCAATAAAGGGGATTCATCCTCATCAACCGATGATTCTGAGCAAGGCCCTCCTCAAGAAGCTGTTTTGAAGGCCATTTCAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776970.1
MACRIALRTVFLTETWMPLPFIHNTLSSFRPIKKISTSNLSCGCKIAANSKSCQFSRYCSNKGDSSSSTDDSEQGPPQEAVLKAISEVSKAEGRVGQTTNVVIGGTVADDSTNEWLALDQKVNSYPTVRGFTAIGTGGNDFVQAMVIAVESVLQKPIPEGQVRQKISSGGKYVSVNIGPVQVVSSEQVLSSLSLSLWGKGSMVLFC

XP_057776971.1
MACRIALRTVFLTETWMPLPFIHNTLSSFRPIKKISTSNLSCGCKIAANSKSCQFSRYCSNKGDSSSSTDDSEQGPPQEAVLKAISEVSKAEGRVGQTTNVVIGGTVADDSTNEWLALDQKVNSYPTVRGFTAIGTGGNDFVQAMVIAVESVLQKPIPEGQVRQKISSGGKYVSVNIGPVQVVSSEQVQAVYNAMRQDDRMKYFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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