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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001958`

染色体: Chr07 坐标: 17053524-17055329 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001958`
名称	SmilChr07G001958
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17053524 - 17055329 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995633`
GeneID	`130995633`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995633`
原始查询	`LOC130995633`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1
产物	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1
Arabidopsis	`AT1G27950` (LTPG1) glycosylphosphatidylinositol-anchored lipid protein transfer 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839688] identity=51.3; qcov=0.829; evalue=1.8e-43; confidence=medium
Rice	`Os08g0532800` (OsLTPG22) - identity=48.2; qcov=0.63; evalue=7.25e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995633

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776975.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776975.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776975.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17053925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:17053994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:17054046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B82,C48
`Chr7:17054126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr7:17054149`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr7:17054149`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr7:17055081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:17055158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:17055165`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A23,B128,B15,B27,B29,B45,B83,C42,C81,C86
`Chr7:17055179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776975.1

181 aa

181

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 27-116 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 34-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776975.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	27	116	1.1e-13	51.8	Probable lipid transfer
`XP_057776975.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	34	116	3.8e-09	37.4	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920992.1
TTGATGACTTAAAGGTCCGCCATATATTTGTTGATATTCGTGTATAGTGAATATATATATAGTCAAAAATAGTGGTGAGAAAATAAATAGTTGATGGGAATTAATGAAGGGGAATTGGAAGTTGGTTAATGAAGGTCGCACGTGGCAAGCATGAGGCCGCGTGGTGAAACATTGAATACCATGCCATGATGCATCCTCCAGCTGCGCCTGAGCCACCCCTCATTAATGCCGGAAGCATAGCTTCACCGCCCCTCCCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995633
ATGACCAACAAAACCAGCGCTAAGTTAGCCGCCGCGGCCCTCTGCTTCGCGGTGCTGGGCGTGCTGGCGGCTGGAGCAGCCGAGTCCATCGCCGACAAGTGCGCGGCGGAGTTCCAGAAGGTGACGCAGTGCCTGTCGTTCGTGACGGCGAAGGCGGCGGCGCCGAGCAAGGACTGCTGCACCTCCGTGACGGAGTTGAAGGACGACGATCCGGCGTGCCTCTGCTACATCATTCAGCAGGTCCACAACGGCTCCAACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776975.1
MTNKTSAKLAAAALCFAVLGVLAAGAAESIADKCAAEFQKVTQCLSFVTAKAAAPSKDCCTSVTELKDDDPACLCYIIQQVHNGSNAAVKSMGVQESRLLQLPSACKLANASTTQCPKLLNLPPNSPDAAIFTNASTNATTTPVATPGATGAPSKGDWQKPGVAGCLTVAMAIFVHAFPLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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