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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001961`

染色体: Chr07 坐标: 17134692-17140056 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001961`
名称	SmilChr07G001961
描述	F-box only protein 6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17134692 - 17140056 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995635`
GeneID	`130995635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995635`
原始查询	`LOC130995635`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box only protein 6
产物	F-box only protein 6
Arabidopsis	`AT1G27340` (LCR) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839623] identity=63.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0923900` (OsFbox053) - identity=61.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF03478 (Beta-prop_KIB1-4); PF07734 (FBA_1); PF24750 (b-prop_At3g26010-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776983.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776983.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776983.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776983.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776983.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17139381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:17139393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,C26,C37,C52
`Chr7:17139512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr7:17139586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:17139660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr7:17139891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776983.1

461 aa

230

461

F-box

FBA_1

b-prop_At3g26010-like

Beta-prop_KIB1-4

PF00646 F-box 112-151 aa PF07734 FBA_1 179-335 aa PF24750 b-prop_At3g26010-like 197-380 aa PF03478 Beta-prop_KIB1-4 203-386 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776983.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	112	151	2.1e-08	34.4	F-box domain
`XP_057776983.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	179	335	3.2e-10	40.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057776983.1`	Pfam	`PF24750`	b-prop_At3g26010-like	Repeat	197	380	3.2e-08	33.8	F-box protein At3g26010-like, beta-propeller
`XP_057776983.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	203	386	8.2e-08	32.8	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921000.1
GAAAAAGGAAAAGGTCAATTTAGGGAAGAAGAGAAAGGAAAAATAGCAATCGAGTAGGGTGAAGAAAAGGGAAGAAAAGTTTGCGTACACGGTCAATACTACTCATTGATCGTAAGGGGGTGGTGACGTGTAAATACGGTATTGGCTAGAATAAAACAATAACAAATAAGCAACAACACAACACAAATCCCCCTTCCATCACAACACGCACAGCACGCATTTACATACAACCTTTACATATAGAGAGAGAAAGGGTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995635
ATGATGGAAGGGGTGGCCATGTTACGGCAACTTATTGGCCAGTTACAAGAGGTTTTGGAACTCTACGGTTCTCCTCCTGCGCTCTCTTCCAATTACTTCATTCAGTTTCAACCCACATCGCACCACCAACCTCTCAGATGGTGTTTCTTGAATCTTGAAGGTAGCTCCTTGGAAGACAGTTGTTGCAACATAATAATGACTGCTGGTAAATCTGAAAATCTAAAAATGCTGGAACCGGGCAAACCTCCGCCCTCAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776983.1
MMEGVAMLRQLIGQLQEVLELYGSPPALSSNYFIQFQPTSHHQPLRWCFLNLEGSSLEDSCCNIIMTAGKSENLKMLEPGKPPPSKKARKERSRGKATTATSSNEIMEDHIWKDFPEDLFEAVIARLPIATFFRFRSVCRKWNSLLTSQSFSQQCAQVKHAKSWFYTITHENVNTGAMYDPSLKKWHHPTVPALPTKLIVLPVASAGGLICFLDIGHRSFYVCNPLTRSFKELPARSVKVWSRVAVGMTLNGSSASSGYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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