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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001980`

染色体: Chr07 坐标: 17415221-17422426 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001980`
名称	SmilChr07G001980
描述	probable DNA primase large subunit
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17415221 - 17422426 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995647`
GeneID	`130995647`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995647`
原始查询	`LOC130995647`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable DNA primase large subunit
产物	probable DNA primase large subunit
Arabidopsis	`AT1G67320` (EMB2813) DNA primase, large subunit family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843052] identity=71.1; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0406800` (OJ1723_B06.102-1) - identity=75; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005658 (alpha DNA polymerase:primase complex); GO:0006269 (DNA replication, synthesis of primer)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04104 (DNA_primase_lrg); PF26466 (DNA_primase_lrg_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995647

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057776999.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057776999.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057776999.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057776999.1`
5	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057776999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17416969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C21
`Chr7:17416996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B140,C59,C77
`Chr7:17420059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17421178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:17421207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776999.1

452 aa

226

452

DNA_primase_lrg_N

DNA_primase_lrg

PF26466 DNA_primase_lrg_N 28-226 aa PF04104 DNA_primase_lrg 268-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776999.1`	Pfam	`PF26466`	DNA_primase_lrg_N	Domain	28	226	1.9e-56	191.8	Eukaryotic and archaeal DNA primase, large subunit N-terminal domain
`XP_057776999.1`	Pfam	`PF04104`	DNA_primase_lrg	Domain	268	436	2e-68	230.2	Eukaryotic and archaeal DNA primase, large subunit C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921016.1
CGAAACTAATCACATCAAAAACTTCACAAATCATCTTTTTTGTGCTCAATTGCTTGAAAACGCAAACCAACTAAAGAGATTTGCAGAAAATGATTCGTTGAATTGTATCATGTGGGGCTTTAAAGTTATGAAATGGGCTTTGTAACGAAGCCCAATCCATAAACAAAATGGAGGGAACCCGTTTCCCGCCATTTTCCCCCCTCACAACATTGTGCGGTTTCTTCTCCTGTTGTTCAGCTTCGTTGATTGGAACACTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995647
ATGGAAATCGTCGGTTCACGCAGGAAACCCTTGCTATCCTCAGCAGGCGACGCCGCTCCGACGATCCCTATATACCGCTCTGCGCCGGAACTCGAAGTCCGGCTCGAAGATTTTGAGCTCTATGCTGTTCATCGTCTTCGAGTTCTCAAAGGAATTTCAGACGGACTATCCCGTGGGAAGAAACCAAACGAGATGGAAAATCTGGTAAAGGAATTATTAAAGGTACACATGAGTCACCCAGAAGCATCTGAAGTTACGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776999.1
MEIVGSRRKPLLSSAGDAAPTIPIYRSAPELEVRLEDFELYAVHRLRVLKGISDGLSRGKKPNEMENLVKELLKVHMSHPEASEVTNKDIISHFVLRLVYCREEELRRWFLSMETTLFRYRFLLETSEAQRALLTEFDLPYKAVTNAEYENVKEKLNQVARSTNSSADTIYYKVPFEQVPDLVASRRVFIMKGHAYVAMNQVVSLLMTQYRSHLSKALVLTNRKWTSMIREQEKDRLTPIVEALSTSYLGPDYSQPKDFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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