当前解析结果
SmilChr07G001986| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001986 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001986 |
| 描述 | protein LAZY 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 17490742 - 17493848 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995652 |
|---|---|
| GeneID | 130995652 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995652 |
| 原始查询 | LOC130995652 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein LAZY 1-like |
| 产物 | protein LAZY 1-like |
| Arabidopsis | AT5G14090 (AT5G14090)regulator of nonsense transcript protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831258] identity=33.2; qcov=1.03; evalue=2.82e-47; confidence=low |
| Rice | Os11g0490600 (LA1)- identity=27.7; qcov=0.557; evalue=5.06e-12; confidence=low |
| GO | GO:0009630 (gravitropism); GO:2000012 (regulation of auxin polar transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995652 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057777002.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057777002.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057777002.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057777002.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777002.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:17491517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B64,C48 |
Chr7:17491615 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。