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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002003`

染色体: Chr07 坐标: 17761598-17766011 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002003`
名称	SmilChr07G002003
描述	uncharacterized SmilChr07G002003
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	17761598 - 17766011 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995666`
GeneID	`130995666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995666`
原始查询	`LOC130995666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsAH; symbol=OsAH; hit=Os12g0468600; species=rice; confidence=high
产物	OsAH; symbol=OsAH; hit=Os12g0468600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0468600` (OsAH) - identity=72.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016810 (hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds)
KEGG	-
Pfam	PF01979 (Amidohydro_1); PF07969 (Amidohydro_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777021.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777021.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777021.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777021.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:17762409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:17762518`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C5
`Chr7:17762518`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C5
`Chr7:17764132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr7:17764590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17764611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B14,B140,C77
`Chr7:17764611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17764644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr7:17764669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B7,B82,B91,C19,C31
`Chr7:17765467`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17765467`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B14,B140,C77
`Chr7:17765498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B140,C77,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777021.1

465 aa

232

465

Amidohydro_1

Amidohydro_3

PF01979 Amidohydro_1 61-425 aa PF07969 Amidohydro_3 264-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777021.1`	Pfam	`PF01979`	Amidohydro_1	Domain	61	425	8.5e-60	203.5	Amidohydrolase family
`XP_057777021.1`	Pfam	`PF07969`	Amidohydro_3	Domain	264	391	9.9e-15	55.7	Amidohydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921038.1
GATACATTGGGATTCAGTGAGTAGTGATGCGTAAGATGACAGCAGGTATGTCTTATGAGAAAGAAAAGAACGTCTAAAGTTGACTTGATTATTTACATTTGTCCATAAAAATATTTGAGTTGATTGATTTTACTAGTGTTTTCATTGAGTAAAACAAAGTGTAATCGAACTCAATAAATTTGCCGGCGAACTTGAAGTTTTAAATCTTGATTGAGGAATTCTGTGTGAATTAATCGATTCGAACAAACTCACCCATGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995666
ATGGAAGAAATAGTAATACTACACGATGCCTTGATTGTAACCATGGATTCACAGAATCGCGTGTTCCGAAACGGTGCCGTTGCTGTGCGGGGCGACACCATTGTAGCTCTTGGTCACTCGCAGGATATTATTTCCCAATTCTCATCTCTTTCGCCTCAACTCATCGACCTCTGCGGCCGCTTTTTGCTGCCAGGGTTGATAAACACACATGTTCACACCTCACAGCAACTAGCTAGAGGGATAGCTGATGATGTTGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777021.1
MEEIVILHDALIVTMDSQNRVFRNGAVAVRGDTIVALGHSQDIISQFSSLSPQLIDLCGRFLLPGLINTHVHTSQQLARGIADDVDLLTWLHDRIWPYESNMTEEDSYISTLLCGIELIHSGVTCFAEAGGQHVSGMARAVELLGIRACLTQSVMDDGDGLPASWATRTAEQCIQSQRDLHKKHHNTADGRIRIWFGIRQIMNSTDRLLTDTRDAAKELNTGIHMHVAEILYENQLVVKRKGVDHGTVSYLEKIKLLQSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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