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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003789`

染色体: Chr01 坐标: 56269619-56278016 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003789`
名称	SmilChr01G003789
描述	ion channel CASTOR-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56269619 - 56278016 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995673`
GeneID	`130995673`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995673`
原始查询	`LOC130995673`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ion channel CASTOR-like
产物	ion channel CASTOR-like
Arabidopsis	`AT5G49960` (AT5G49960) ion channel protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835060] identity=68; qcov=0.784; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0843600` (Os-CASTOR) - identity=74.2; qcov=0.856; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006811 (monoatomic ion transport)
KEGG	-
Pfam	PF06241 (Castor_Poll_mid); PF22614 (Slo-like_RCK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995673

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057777032.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057777032.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777032.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777032.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56269980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B36,C58
`Chr1:56270083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C62
`Chr1:56270121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:56270466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B56,B96,C5,D3
`Chr1:56271710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C80
`Chr1:56272150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:56273759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,D11
`Chr1:56274103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B68
`Chr1:56274144`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A21
`Chr1:56274144`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A21
`Chr1:56275228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:56275849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777032.1

902 aa

451

902

Slo-like_RCK

Castor_Poll_mid

PF22614 Slo-like_RCK 368-474 aa PF06241 Castor_Poll_mid 511-608 aa

XP_057777040.1

902 aa

451

902

Slo-like_RCK

Castor_Poll_mid

PF22614 Slo-like_RCK 368-474 aa PF06241 Castor_Poll_mid 511-608 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777032.1`	Pfam	`PF22614`	Slo-like_RCK	Domain	368	474	4.8e-09	36.6	Calcium-activated potassium channel slowpoke-like RCK domain
`XP_057777032.1`	Pfam	`PF06241`	Castor_Poll_mid	Family	511	608	1.9e-45	153.8	Castor and Pollux, part of voltage-gated ion channel
`XP_057777040.1`	Pfam	`PF22614`	Slo-like_RCK	Domain	368	474	5.2e-09	36.5	Calcium-activated potassium channel slowpoke-like RCK domain
`XP_057777040.1`	Pfam	`PF06241`	Castor_Poll_mid	Family	511	608	1.9e-45	153.8	Castor and Pollux, part of voltage-gated ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921049.1
TTGAATTATTTGTCTGCATTAGTATATTTTTAAATTTTCTAAAGTCTCAACTGAAGGGATCAAATTTATACACTATTACTATAAGACAACATATTTATTTTATTCAACATATAAATCCAAAAGTCATAATTCAATTACTCCTGAAACATATACAGTTATCAAATTACCCCTCGCAATCTCATAGAATTCCAAACATGGCCTTCAACTCCGATGGCTCGCAGCCGTCGACCTCGTCGCCGGCGGAGGCAGCAGCCACAACA...

XM_057921057.1
TTGAATTATTTGTCTGCATTAGTATATTTTTAAATTTTCTAAAGTCTCAACTGAAGGGATCAAATTTATACACTATTACTATAAGACAACATATTTATTTTATTCAACATATAAATCCAAAAGTCATAATTCAATTACTCCTGAAACATATACAGTTATCAAATTACCCCTCGCAATCTCATAGAATTCCAAACATGGCCTTCAACTCCGATGGCTCGCAGCCGTCGACCTCGTCGCCGGCGGAGGCAGCAGCCACAACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995673
ATGGCCTTCAACTCCGATGGCTCGCAGCCGTCGACCTCGTCGCCGGCGGAGGCAGCAGCCACAACAAGAGACTGGATTTTCCCTTCATACTCATTCGTCCACTCGACGCATAACATCCGGAGAACCCCCAGAAGAAGAAGAGTCTCCTCCTACCATCCACCGCTGGCGCAGCAATTCAACTCCGCCGCGGCGGCGTCCTCAACCGGAGACGACTCTAATTCCTTCACCACTTCCTCTCCAAGTTTTAGACCGCGGGGTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777032.1
MAFNSDGSQPSTSSPAEAAATTRDWIFPSYSFVHSTHNIRRTPRRRRVSSYHPPLAQQFNSAAAASSTGDDSNSFTTSSPSFRPRGFEFGNYERSTRLLADGPDGPAAAAVKSNDAVSLEKETQTTYSEKTFSKFFRSGLRIRPQLAFSVSIVTTVLSSLLSKNFTLHKEVTELQDQISKLNVRLRLCNLLDSPDVYNSSPQDVSIDPNKSLKIAALLVSIMLLVLPLLFFFKNVDYISSSRRQIDNNSEEVSLNKQLAY...

XP_057777040.1
MAFNSDGSQPSTSSPAEAAATTRDWIFPSYSFVHSTHNIRRTPRRRRVSSYHPPLAQQFNSAAAASSTGDDSNSFTTSSPSFRPRGFEFGNYERSTRLLADGPDGPAAAAVKSNDAVSLEKETQTTYSEKTFSKFFRSGLRIRPQLAFSVSIVTTVLSSLLSKNFTLHKEVTELQDQISKLNVRLRLCNLLDSPDVYNSSPQDVSIDPNKSLKIAALLVSIMLLVLPLLFFFKNVDYISSSRRQIDNNSEEVSLNKQLAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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