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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002674`

染色体: Chr07 坐标: 26062822-26066440 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002674`
名称	SmilChr07G002674
描述	transcription factor BHLH094-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26062822 - 26066440 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995683`
GeneID	`130995683`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995683`
原始查询	`LOC130995683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor BHLH094-like
产物	transcription factor BHLH094-like
Arabidopsis	`AT1G59640` (BPEp) transcription factor BIG PETAL P (BPE) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842254] identity=52.8; qcov=0.811; evalue=7.44e-81; confidence=high
Rice	`Os07g0193800` (OsbHLH094) - identity=65.3; qcov=0.487; evalue=7.09e-71; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995683

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777054.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777054.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777054.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777054.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777054.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26064295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:26066029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:26066203`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A25,B104,B105,B114,B123,B133,B14,B36,B65,B91,C10,C18,C28,C39,C7,C72,C77,C86
`Chr7:26066267`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	85	A1,A13,A25,A4,B10,B100,B101,B106,B11,B112,B117,B126,B131,B135,B139,B17,B18,B19,B23,B24,B26,B27,B29,B3,B31,B32,B33,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B51,B54,B57,B58,B62,B66,B67,B69,B72,B74,B78,B81,B87,B88,B9,C11,C16,C18,C19,C22,C27,C30,C32,C33,C34,C35,C37,C42,C47,C49,C52,C53,C57,C58,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C74,C75,C79,C82,C83,C85,C87,D10,D11,D2,D4,D7
`Chr7:26066298`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	133	A1,A13,A16,A2,A21,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B106,B108,B11,B110,B111,B112,B117,B119,B121,B122,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B135,B136,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B23,B24,B27,B29,B3,B31,B32,B33,B35,B4,B40,B41,B42,B43,B48,B51,B53,B54,B56,B57,B58,B60,B61,B66,B67,B69,B7,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B81,B84,B87,B88,B9,B90,B96,B99,C10,C11,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C26,C27,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C46,C50,C53,C54,C58,C59,C60,C63,C64,C65,C66,C69,C70,C73,C74,C75,C78,C81,C82,C83,C84,C85,C87,D10,D11,D2,D3,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777054.1

356 aa

178

356

HLH

PF00010 HLH 240-287 aa

XP_057777055.1

355 aa

178

355

HLH

PF00010 HLH 240-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777054.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	240	287	1.1e-08	35.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057777055.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	240	287	1.1e-08	35.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921072.1
TTAGTGGCAGGCGCAGGTAAGCCAGTTGTAGAGTAAAATAGCACGTAAGCCTTAAGACATGAAGCGCTGGAGGCTCCGAGAAAAGCTCACTCAAAGTCACTTCTTTTCAACTCCCAAGGTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTAGATTGGAGAAGCACTGTGTCTGTGTGTGTGCTGGTAGTAGCCATTGTACGCCACTGCGTACTGTACTCACCCAACAACCTGCACTCTTTCAAGGAAAGAAGATCCACTCCATTTGTC...

XM_057921071.1
TGGCAGGCGCAGGTAAGCCAGTTGTAGAGTAAAATAGCACGTAAGCCTTAAGACATGAAGCGCTGGAGGCTCCGAGAAAAGCTCACTCAAAGTCACTTCTTTTCAACTCCCAAGGTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTAGATTGGAGAAGCACTGTGTCTGTGTGTGTGCTGGTAGTAGCCATTGTACGCCACTGCGTACTGTACTCACCCAACAACCTGCACTCTTTCAAGGAAAGAAGATCCACTCCATTTGTCCCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995683
ATGAAGCGCTGGAGGCTCCGAGAAAAGCTCACTCAAAGTCACTTCTTTTCAACTCCCAAGGTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTAGATTGGAGAAGCACTGTGTCTGTGTGTGTGCTGGTAGTAGCCATTGTACGCCACTGCGTACTGTACTCACCCAACAACCTGCACTCTTTCAAGGAAAGAAGATCCACTCCATTTGTCCCCTTCCCTCCTATACATTCACACACCCTCCTGTATCTATACATTCATGCTCCTCCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777054.1
MKRWRLREKLTQSHFFSTPKVSLSLSLSRLEKHCVCVCAGSSHCTPLRTVLTQQPALFQGKKIHSICPLPSYTFTHPPVSIHSCSSARPDRPMDPQGPAMMNEGGVYNFAEIWPAFQMNAAATSYGLGLDPMVMDQRSNHTPPNHNSRKRREDDDCVKGGASTSNSNGNSNNTTNNNNNNVMSEGDNKRLKAVGSNHAPETKTEGEVNSTKASEALAKPADPSKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMRILQ...

XP_057777055.1
MKRWRLREKLTQSHFFSTPKVSLSLSLSRLEKHCVCVCAGSSHCTPLRTVLTQQPALFQGKKIHSICPLPSYTFTHPPVSIHSCSSARPDRPMDPQGPAMMNEGGVYNFAEIWPAFQMNAAATSYGLGLDPMVMDQRSNHTPPNHNSRKRREDDDCVKGGASTSNSNGNSNNTTNNNNNNVMSEGDNKRLKAVGSNHAPETKTEGEVNSTKASEALAKPADPSKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMRILQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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