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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002697`

染色体: Chr07 坐标: 26312832-26315637 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002697`
名称	SmilChr07G002697
描述	thioredoxin H2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26312832 - 26315637 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995709`
GeneID	`130995709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995709`
原始查询	`LOC130995709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin H2-like
产物	thioredoxin H2-like
Arabidopsis	`AT5G39950` (TRX2) thioredoxin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833992] identity=50.4; qcov=0.993; evalue=6.09e-49; confidence=medium
Rice	`Os07g0186000` (TRXH) - identity=51.8; qcov=0.797; evalue=1.88e-39; confidence=medium
GO	GO:0015035 (protein-disulfide reductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF00578 (AhpC-TSA); PF13098 (Thioredoxin_2); PF13905 (Thioredoxin_8); PF14595 (Thioredoxin_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777085.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057777085.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057777085.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777085.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777085.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26313068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C17
`Chr7:26313152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777085.1

138 aa

138

Thioredoxin_2

Thioredoxin_9

Thioredoxin

AhpC-TSA

Thioredoxin_8

PF13098 Thioredoxin_2 45-128 aa PF14595 Thioredoxin_9 46-115 aa PF00085 Thioredoxin 46-134 aa PF00578 AhpC-TSA 49-128 aa PF13905 Thioredoxin_8 53-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777085.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	45	128	2e-11	44.9	Thioredoxin-like domain
`XP_057777085.1`	Pfam	`PF14595`	Thioredoxin_9	Family	46	115	9.3e-08	32.7	Thioredoxin
`XP_057777085.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	46	134	1.2e-29	103.0	Thioredoxin
`XP_057777085.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	49	128	2.5e-06	28.2	AhpC/TSA family
`XP_057777085.1`	Pfam	`PF13905`	Thioredoxin_8	Domain	53	93	5.6e-09	37.0	Thioredoxin-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921102.1
TTTTTTTTTTTTTTTTTATGTTGGTACTTTTGGCACTAATATTGTCATTTGTGCCAAAAGTACAAATTTACTTAATTTTTTTTTCTTCATGTTGGTACTTTTGGCACTAATAGTGTCAAATGTACCTAACCCGCGCGCAAACCCGAATTCGGTCCACCCTAATTAAGGGCAAAATAGTTCTAAGACGTAAAAAATAACCAAAATTTGTATTTTTTAAATGGATGACCAAATATTGAATTTCATTGCTCAATATGGCTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995709
ATGGGAGCCAATGTTTCAACAGCTTATGACGCCCAAGGCTCGCCAAGACAGAGGTCACTGGCGCCGTCGCAGCCGCCAGCCAAGAAGGGCCAGCTCATCGCATTCCACTCCTCAGCAAAGTGGAAACTCCATTTCGAAGCAGCCAAGCAGACTTCAAAACTGATCGTCGTCGACTTCACCGCCTCGTGGTGCGGGCCGTGTAAGCAGATTCTCCCTGCGATCAACGAGTTCGCCGAGAAATACGCAGACGTCGATTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777085.1
MGANVSTAYDAQGSPRQRSLAPSQPPAKKGQLIAFHSSAKWKLHFEAAKQTSKLIVVDFTASWCGPCKQILPAINEFAEKYADVDFIKIDVDELDDVAEEYGVQAMPTFILIKKGKQVDKIVGAKKDDLQNKIEKHRF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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