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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002710`

染色体: Chr07 坐标: 26532371-26538924 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002710`
名称	SmilChr07G002710
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.6-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26532371 - 26538924 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995721`
GeneID	`130995721`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995721`
原始查询	`LOC130995721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.6-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.6-like
Arabidopsis	`AT1G69850` (NRT1:2) nitrate transporter 1:2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843321] identity=64.8; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0581000` (OsNRT1.2) - identity=62.8; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995721

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777100.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777100.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777100.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777100.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26533146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B99,D10
`Chr7:26536183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C49,C50,C58
`Chr7:26536355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:26536387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr7:26537957`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr7:26537957`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr7:26537959`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr7:26537959`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr7:26538117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C17
`Chr7:26538209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B73,B75,C1
`Chr7:26538330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C57,D4
`Chr7:26538482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C57,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777100.1

549 aa

274

549

PTR2

PF00854 PTR2 99-499 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777100.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	99	499	1.4e-96	324.5	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921117.1
AAAAGAACCGCAGACTGTTCCTTCTTCTTTTCAGCCCTCCAATTATAAAAGAATATCAATCCTTACAATCTAGTACAAACCCCCCATCGTCTCTAATCCACTACTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACATATCATTCCTTCTAAAATACTTTCATCCAGAGAGAGAGAAATGGAAATGGAAAACCAATTATGGGAGGGATATGTTGATTGGAGAGGCAAAGCTGCTGTCAGAACCAAACATGGCGGCATGAGGGCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995721
ATGGAAATGGAAAACCAATTATGGGAGGGATATGTTGATTGGAGAGGCAAAGCTGCTGTCAGAACCAAACATGGCGGCATGAGGGCTGCCTTCTTTGTTTTAGTTGTGGAGGTATTGGAGAATTTGGCGTACCTGGCGAATGCAAGCAACTTGGTGTTGTACCTTTCGCAATACATGCATTTTTCGCCGTCGCAGGCGGCCAACTCCGTCACCAATTTTATGGGCACGGCGTTTCTTTTAGCCCTTCTTGGTGGCTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777100.1
MEMENQLWEGYVDWRGKAAVRTKHGGMRAAFFVLVVEVLENLAYLANASNLVLYLSQYMHFSPSQAANSVTNFMGTAFLLALLGGFLSDAFFTTYLIYIISAMTEFLGLIILTMQAKSSSLQPPKCGRKLQGETECSQVEGAKAVLLFSGLYLVALGVGGIKGSLPAHGAEQFDGSTPRGRKQRSSFFNYFVFSLAAGSLIAVTLVVWIEDNIGWQWGFGISTLTILLSVPIFLAGSTFYRNKIPRGSPLTTISKVVIGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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